シリコンベース DNA 合成の力

Twist Bioscience’s high precision, silicon-based high-throughput gene synthesis platform enables us to produce high quality gene fragments starting at 7¢ (USD) per bp and NGS-verified sequence perfect clonal genes starting at 9¢ (USD) per bp. これは必要な DNA 配列を、ご希望のスケール、お求めやすい価格、そして短納期で入手いただけることを意味します。

Twist の人工遺伝子製品

Twist の人工遺伝子製品は、お客様がご希望の DNA を、ご希望の形態で手に入れることのできる柔軟さを備えています。幅広い視点で設計の可能性を広げ、研究を加速させてください。ご不明点がございましたら、ぜひ当社の専門チームにご相談ください。

ご利用の流れ

Normally, genes are synthesized with one gene per 96 well plate. Here at Twist, we have perfected gene synthesis and with our proprietary platform is able to synthesize 9600 genes per one silicon-based chip in a single run. This means we can produce 1 gene or 100,000 genes in parallel, in the same amount of time.

Twist Bioscience は、配列の正確性や品質を損なうことなく、これまでにない短納期で遺伝子をお届けします。ご利用の流れは下記をご参照ください。

カスタム配列を設計していただくだけで、あとは当社の高品質な遺伝子合成プラットフォームにお任せください。

研究用途に限ります。診断目的には使用できません。
 

* Calculated Twist internal data using Dr. Oligo benchmark January 2021 and validated by SRI Quality System Registrar and Silinnov Consulting in 2023

* 本ツールは説明目的として提供されているものであり、記載されている利点、サポート、利益計算、その他の結果は概算値です。これらの概算値は提案または見積書を構成するものではありません。

お客様の声

 

お客様の声

Clariant は、Twist Bioscience で多数のさまざまな宿主生物向けベクターを登録しました。Twist Bioscience の遺伝子合成とカスタムクローニングサービスの高い成功率と短納期を活用しています。当社の目標は、日常的な分子生物学的作業のほとんどを外注することで、研究リソースを集中させ、開発スピードを向上させることにあります。

HELGE JOCHENS 博士

Clariant

Twist の遺伝子断片は品質が高く、これらを使ったクローニングは、他社の遺伝子断片を使う場合よりも、初回で成功することが多いと思います。

AMANDA PORTILLO 博士

システム生物学・合成生物学研究所(Institute of Systems and Synthetic Biology)

Twist のオンライン注文サイトをとても気に入っています。サイトでは合成の可否がすぐに分かるからです。合成したい配列を入力すると、Twist のアルゴリズムが「はい、問題ありません」と答えてくれます。難しい配列でも Twist にとっては簡単に作れることが分かりました。

PHILIPPE MARLIERE 博士

システム生物学・合成生物学研究所(Institute of Systems and Synthetic Biology)

TCRlib Logo

オンライン注文がより簡単になりました。eCommerce 注文プラットフォームから遺伝子をオンライン注文する方法については「How to」ビデオをご覧ください。

Clonal Genes

Twist Bioscience は、毎月数十万遺伝子を合成するプラットフォームを用いて、お客様のDNA に関するあらゆるニーズにお応えします。当社のシリコンベース DNA 合成プラットフォームは、さまざまな鎖長や難易度の Clonal Genes を完璧な配列で大量に作製することが可能です。すべての配列は NGS で確認し、正確性を確認しています。With our Express Genes service, clonal genes can be synthesized and shipped out to you in as fast as 4 days.* プラスミド調製のオプションは、ワンクリックで簡単にご指定いただけます。お客様の実験に合わせた DNA をお届けするため、幅広いオプションをご用意しております。

アイコン 当社の Express Genes サービス

Twist Bioscience’s Express Genes service provides you with the same NGS-verified, sequence perfect Clonal Genes you would expect from our standard Clonal Genes but with the added bonus of an all time fast order to ship turnaround time of 4-7 business days.

Clonal Genes の詳細につきましては、以下をご覧ください。

Express Genes サービスの表

今すぐ注文して DNA を最速で入手するにはこちら

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特長

低コストかつ高品質

 
  • 1 塩基対あたり 9 セント~
  • サブクローニングや DNA 配列の複雑さによる追加料金なし
  • 最短 10 営業日で出荷
  • 米国内で製造

用途に合わせた DNA

 
  • 0.3 ~ 5.0 kb の遺伝子をお客様指定のプラスミドにクローニング
  • Twist カタログベクターまたはお客様がご登録されたベクターからご指定可能
  • 4 prep scales (50ng – 2µg | 2µg – 10µg | 10µg – 100µg | 100µg – 1mg)
  • 濃度調整とエンドトキシンフリーのオプションをご用意

スケーラブルな合成

 
  • ご注文数の上限なし
  • ご注文数量に関わらず同じ納期

サステナビリティ

 
  • 業界標準と比べて二酸化炭素排出量を大幅に削減
  • Twist の人工遺伝子はお客様の気候変動に関する目標やコミットメント達成を支援
  • Twist の人工遺伝子はお客様の温室効果ガス排出量削減に貢献

データ

配列完全一致の Clonal Genes

上の図はすべての Clonal Genes で実施さている、NGS を用いた品質保証データの例を示しています。この図に示されている Clonal Genes はエラーのないクローンの一例です。プラスミド全体にわたってリードが得られており、SNP や indel は検出されていません。


*ご利用条件:Eligible Express Genes ship in 4-7 business days. 納期は配列の複雑さや鎖長によって変動します。米国外からの注文では、追加の配送時間がかかります。Clonal Genes の納期は、カスタマイズや複雑さに基づいて変動します。Average turnaround time for Clonal Genes is 10 business days. Express Genes と Clonal Genes のどちらでも、お客様が登録したカスタムベクターでクローニングする場合は追加のお時間がかかります。価格計算ツールは、Gene Fragments および Clonal Genes のみを対象としており、Express Genes サービスの価格は含まれておりません。

研究用途に限ります。診断目的には使用できません。

FAQ

はい、可能です。1遺伝子あたり 10 ドルの追加料金がかかります。

You can find the pricing table for Clonal Gene products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under .

Twist は、最大 7,000 bp までの合成遺伝子を、当社のどの カタログベクターにもクローニングいたします。We also offer cloning into your own custom vector.

No - at this time, Twist does not have vectors for expression in plants; however, we can onboard a custom vector as long as it meets our requirements.

解析証明書(COA)は出荷後に発行されます。You can find the COA for Clonal Gene products in your account by clicking here.
 

AI と Clonal Genes を用いて、病原体が血液から鉄を奪い取ることを阻害するタンパク質を設計

AI/ML と Twist Clonal Genes を用いて、バクテリアによるヘム鉄の奪取を阻害する結合タンパク質を短期間で設計、スクリーニングしたメルボルン大学の Rhys Grinter 博士のお話をお聞きください。

Gene Fragments

DNA は分子生物学研究の基盤であり、品質の低い DNA を用いると貴重な時間やリソースが無駄になります。Twist の Gene Fragments によって、手頃な価格で(追加費用なし)、信頼性の高い遺伝子合成を迅速に利用することができます。By minimizing the need for colony screening with our 1:7500 error rate, our Gene Fragments help streamline cloning workflows, saving you resources downstream.


Order Now or Get the Product Sheet.

特長

短納期かつ経済的

 
  • 1 塩基対あたり 7 セント~
  • オプション費用なし
  • 2 ~ 4 営業日以内に出荷*
  • 米国内で製造

お客様のワークフローに合わせて設計

 
  • 長さ:300 bp ~ 5000 bp
  • 収量:100 ng ~ 1 µg
  • 業界トップクラスの低エラー率(1 : 7500)

用途に合わせた DNA

 
  • カスタマイズによる追加費用や納期への影響なし
  • 同じプライマーセットで増幅可能なアダプターも追加可能
  • 納品形態をチューブとプレートから選択可能
  • バッファー溶液での納品や濃度調整のオプションあり
  • 最小発注量、最大発注量の縛りなし

サステナビリティ

 
  • 業界標準と比べて二酸化炭素排出量を大幅に削減
  • Twist の人工遺伝子はお客様の気候変動に関する目標やコミットメント達成を支援
  • Twist の人工遺伝子はお客様の温室効果ガス排出量削減に貢献

データ

他社製品と一線を画す、超低エラー率の Twist DNA 合成技術

二本鎖 DNA 断片製品を直接比較した結果、Twist Gene Fragments は一貫して最も低いエラー率を示しました。下のグラフは、Twist Gene Fragments および IDT 社製品の遺伝子配列における平均エラー率を示しています。Twist Gene Fragments は eBlocks および gBlocks と比較して、より高い正確性を持つことが分かります。特に gBlocks と比べると、Twist Gene Fragments は平均で約 2 倍高い正確性を示しました。

より完璧な遺伝子を Twist から

Twist Gene Fragments では、一貫して最も高い割合で完全なクローンを得ることができるため、お客様の研究にかかる時間とコストを削減することができます。The graph to the left shows a direct comparison of the percentage of sequence perfect clones across a wide variety of gene lengths and sequences for 3 different gene products. Data was generated using a set of 63 sequences with a wide variety of gene lengths to reflect the diversity of gene lengths required for various real-world synthetic biology applications.

*この日数は当社施設内での通常処理時間であり、配送業者へ引き渡すまでの目安です。

FAQ

You can find the pricing table for Gene Fragment products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under .

以下の方法で、アダプター付き遺伝子フラグメントをクローニングできます。

Restriction digestion/Ligation - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning

Type IIS or Golden Gate - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning TOPO cloning (blunt-end) - the adapter sequences will be cloned in as well

Gateway cloning - add attB sites to the ends of your sequence

For more information, click here.

Adapter-On Gene Fragments の場合、各断片の末端にユニバーサルアダプターが合成されます。アダプターの長さは 21 ~ 22 ヌクレオチドです。アダプター付き DNA 断片は、制限酵素消化/ライゲーション、Gateway、Golden Gate、TOPO クローニングなど、多くのアセンブリ手法に対応しています。

アダプター内に制限部位を加えることで、アダプターを取り除くことができます。TOPO クローニングにもご利用いただけますが、アダプターは付いたままになります。
アダプター配列

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。

ご注文につきましてご不明な点がございましたら、{{[email protected]}} までお問い合わせください。

 

 

はい。Gene Fragments については、ビーズを用いて精製を行いますが、短い断片については少量の場合は実施しないこともあります。

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。


If you have any questions about your order, please contact us at customersupport@twistbioscience.com

Resurrect Bio が Clonal Genes と Gene Fragments を用いて、 AI 駆動型の植物形質探索を進めたケーススタディ

Dr. Binnian of Resurrect Bio shares how her team uses AI-driven gene design and Twist Genes to tackle plant immunity challenges, rapidly screening thousands of sequences from in silico prediction to in planta validation.

Clonal Genes 製品シート

Twist Bioscience は、合成生物学や分子生物学の基盤となる遺伝子合成に変革をもたらしています。当社のシリコンベース DNA 合成プラットフォームは、合成のスループットとスケーラビリティを大きく向上させるだけでなく、納期を短縮し、1 塩基あたりの価格を下げました。

 

Gene Fragments 製品シート

Twist Bioscience の Gene Fragments は、コロニースクリーニングを最小限に抑えることで、クローニングプロセスを改善します。これによりクローニングとシーケンシングのコストを大幅に削減でき、時間とコストの節約につながります。

より良い DNA アセンブリラインの構築
Arzeda は、Labcyte、TeselaGen、Twist Bioscience の技術を活用し、合成生物学のワークフローを加速させています。
感染症に対する抗体の開発を迅速化
DARPA から、医療従事者がウイルス性疾患と戦うための対応策を短納期で開発するという課題を課されたヴァンダービルト大学医療センターは、Twist のツールを利用して抗体開発に要する時間を大幅に短縮しました。開発期間の短縮を支えたのは Twist Bioscience のハイスループット人工遺伝子です。

5 kb の遺伝子合成による人工代謝経路設計
代謝工学のアプリケーションでは、研究者が微生物をリプログラミングして目的の非天然分子を生産するために、設計-構築-試験(Design-Build-Test)のサイクルを短納期で回すことが不可欠です。研究では通常、1 つの遺伝子または代謝経路全体の遺伝子を宿主生物に組み込みます。導入する遺伝子は、微生物宿主で発現させると、ありふれた物質を基質として有用な物質へと変換します。
Twist 人工遺伝子に関するアドバイス:人工遺伝子の設計方法
Twist Bioscience は、シリコンベース DNA 合成プラットフォームを用いて高品質な人工合成 DNA を作製しています。Twist Bioscience のオンライン注文プラットフォームでは簡単に遺伝子の設計・注文が可能です。本書では、Twist の Clonal Genes および Gene Fragments を、さまざまなアプリケーション向けに最適化しカスタマイズするためのヒントをご紹介します。
Twist 人工遺伝子に関するアドバイス:人工遺伝子の最小鎖長要件(300 bp 〜)を満たす方法
合成したい配列を送信すると、スコアリングアルゴリズムがその配列をチェックして合成可能かどうかを判断します。その際に最初にチェックされるのが、その配列が 300 bp 以上という鎖長要件を満たしているかどうかです。この最低鎖長要件を満たさない場合の配列設計に本書をご活用ください。
デザインからタンパク質へ:Twist Gene Fragments を用いた無細胞タンパク質発現

Amyris が菌株最適化のための次世代プラットフォームについて語る 
このウェビナーで、Twist の人工遺伝子がこの革新的企業による微生物工学の取り組みにどのように貢献しているかをご覧ください。https://www.twistbioscience.com/genes_bioengineeringwebinar_sunilchandran

Twist DNA 再懸濁ガイドライン
Gene Fragments クローニングガイドライン
Twist Bioscience's Gene Fragments are double-stranded DNA, 300 to… 5000 base pairs in length. Adaptor-On 製品には、5' 末端、3' 末端にアダプター配列が付加されています。
Twist グリセロールストックの取扱説明書

Broad-spectrum anti-CRISPR proteins facilitate horizontal gene transfer
Machine Learning-Guided Prediction of Antigen-Reactive In Silico Clonotypes Based on Changes in Clonal Abundance through Bio-Panning
Crystal structure of Nsp15 endoribonuclease NendoU from SARS-CoV-2
Continuous evolution of SpCas9 variants compatible with non-G PAMs
Convergent selection in antibody repertoires is revealed by deep learning
The LRRC8A:C Heteromeric Channel Is a cGAMP Transporter and the Dominant cGAMP Importer in Human Vasculature Cells
De novo protein design enables precise induction of functional antibodies in vivo
In situ readout of DNA barcodes and single base edits facilitated by in vitro transcription
A bottom-up approach for the de novo design of functional proteins

全般

Twist Bioscience attests that the company adheres to all requirements in the U.S. Office of Science and Technology Policy (OSTP)  Framework for Nucleic Acid Synthesis Screening.
Download the attestation here.

Twist Bioscience では、DNA 製品を乾燥状態や、2 mL マイクロ遠心チューブ、96 ウェルプレートまたは 384 ウェルプレートに再懸濁させた状態で出荷しています。乾燥させた DNA は常温で、再懸濁させた DNA は冷凍で出荷されます。

二本鎖 DNA および一本鎖オリゴヌクレオチドは、ほとんどのラボで採用されている標準的な保存条件において安定です。しかし、Twist Bioscience で合成された DNA の品質を高い状態に保つには、以下のような保存条件を推奨しています。

  • Twist では、乾燥 DNA の保存期間について、保存条件に応じて以下の期間を推奨しています。
    • 室温:3 ヶ月
    • 4 °C: 12 ヶ月
    • −20 °C : 24 ヶ月
    • −80 °C :長期保存
  • 再懸濁のガイドライン
    • 再懸濁する場合は、開封前にチューブまたはプレートを軽く遠心してください。ヌクレアーゼフリーの Tris-EDTA(TE)バッファー(pH 8.0)または 10 mM Tris-HCl(pH 8.0)で目的濃度に再懸濁してください。
    • ストック溶液(希釈液)の濃度は 10 ng/μL 以上を推奨しますが、最適濃度はご使用のアプリケーションに応じて設定してください。
    • ストック溶液とは別に必要量ずつ分注して保存すると、コンタミネーションを防ぎ、凍結・融解のサイクルを減らすことができます。分注液は速やかに使用し、高温に長くさらさないようにご注意ください。
  • 再懸濁させた DNA
    • 一部製品では再懸濁させた状態でお届けすることが可能です。お客様からご注文をいただいた DNA は、以下のいずれかのバッファーに再懸濁させた状態でお届けします。開封前にチューブやプレートを軽く遠心分離機にかけることを推奨します。
      • 溶出バッファー(2 mM Tris-Cl、pH 8.5)
      • TE バッファー(10 mM Tris-Cl、pH 8.0、1 mM EDTA)
      • 低 EDTA TE バッファー(10 mM Tris-Cl、pH 8.0、0.1 mM EDTA)
      • 水       
        • 水での長期保存は推奨していません。
    • Twist は、再懸濁させた DNA については保管条件に応じて以下の期間内にお使いいただくことを推奨します。
      • 室温:3 ヶ月
      • 4 °C: 12 ヶ月
      • −20 °C : 24 ヶ月
      • −80 °C :長期保存

Twist はすべての Clonal Genes(プラスミド DNA)合成製品について、NGS を用いて配列の検証を行っています。

一方、Gene Fragments(二本鎖 DNA 断片)については NGS での検証は行っていません。遺伝子合成のエラー率は低く、600 bp、1200 bp、1800 bp の Gene Fragment で配列が完全一致するクローンを 99% の信頼度で取得するためには、それぞれ 3、4、6 クローンをピックアップ、シーケンス確認することを推奨しています。

遺伝子製品は、特に指定のない限り、通常は乾燥ペレットの状態で納品されます。

Clonal Genes は、Twist のカタログベクターまたはお客様独自のカスタムベクターにクローニングした状態で納品されます。Gene Fragments は、直鎖二本鎖配列として納品されます(アダプターの有無はご選択ください)。

これらの遺伝子配列は 96 ウェルプレートまたは 384 ウェルプレートにて納品します。少量のご注文(10 種類未満)の場合、追加料金なしで遺伝子をチューブで納品することも可能です。10 種類以上の遺伝子をご注文の場合、チューブでの納品には 1 回のご注文につき 50 ドルの追加料金がかかります。

Twist の DNA 製品は乾燥状態で、96/384 ウェルプレートまたは 2 ml マイクロチューブで出荷されます。二本鎖 DNA は標準的な保存条件において安定ですが、DNA を高い品質で維持するために、再懸濁や保存については以下を推奨します。

  • 受領後、チューブまたはプレートを軽く遠心し、DNA をヌクレアーゼフリーの Tris-EDTA(TE)バッファー(pH 8.0)または 10 mM Tris-HCl(pH 8.0)にご希望の濃度で再懸濁します。
  • 水での再懸濁は推奨していません。
  • ストック溶液の濃度は少なくとも 10 ng/μl を推奨しますが、ご希望の用途に応じて最適な濃度を決定してください。
  • 作業用にはストック溶液とは別に必要量ずつ分注して保存していただくと、コンタミネーションの可能性を抑え、凍結・融解のサイクルを減らすことができます。
  • 長期保存する場合、保存期間が 1 年以内の場合は DNA を −20 °C、さらに長期間保存する場合は DNA を −80 °Cで保存してください。

Resuspension guideline can be found here

Clonal Genes

You can find the pricing table for Gene Fragment products in your account by clicking here.

If you need to contact your Account Manager regarding pricing, their contact information is available in eCommerce under .

以下の方法で、アダプター付き遺伝子フラグメントをクローニングできます。

Restriction digestion/Ligation - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning

Type IIS or Golden Gate - place restriction sites inside of the Twist adapters for easy cloning TOPO cloning (blunt-end) - the adapter sequences will be cloned in as well

Gateway cloning - add attB sites to the ends of your sequence

For more information, click here.  

Adapter-On Gene Fragments の場合、各断片の末端にユニバーサルアダプターが合成されます。アダプターの長さは 21 ~ 22 ヌクレオチドです。アダプター付き DNA 断片は、制限酵素消化/ライゲーション、Gateway、Golden Gate、TOPO クローニングなど、多くのアセンブリ手法に対応しています。

アダプター内に制限部位を加えることで、アダプターを取り除くことができます。TOPO クローニングにもご利用いただけますが、アダプターは付いたままになります。
アダプター配列

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。

ご注文につきましてご不明な点がございましたら、{{[email protected]}} までお問い合わせください。

はい。Gene Fragments については、ビーズを用いて精製を行いますが、短い断片については少量の場合は実施しないこともあります。

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。


If you have any questions about your order, please contact us at customersupport@twistbioscience.com

コドン最適化

当社ウェブサイト上でのコドン最適化に対応している生物種の一覧:

  • Arabidopsis thaliana
  • Aspergillus niger
  • Aspergillus oryzae
  • Bacillus subtilis
  • Brassica napus
  • Caenorhabditis elegans
  • Cricetulus griseus (CHO)
  • Drosophila melanogaster
  • Escherichia coli
  • Glycine max
  • Homo sapiens
  • Hypocrea jecorina
  • Medicago sativa
  • Mus musculus
  • Nicotiana tabacum
  • Petunia x hybrida
  • Pichia pastoris
  • Pisum sativum
  • Rattus norvegicus
  • Saccharomyces cerevisiae
  • Solanum tuberosum
  • Spodoptera frugiperda
  • Streptomyces coelicolor A3(2)
  • Sus scrofa
  • Toxoplasma gondii
  • Xenopus laevis
  • Yarrowia lipolytica
  • Zea mays

If you do not see your specific organism, contact customersupport@twistbioscience.com

現在のところ「Impossible」と判定された遺伝子の合成はできません。当社のアルゴリズムが遺伝子を「Impossible」と判定する要因はいくつかあり、遺伝子配列ごとに特定のパラメータが用いられています。当社のアルゴリズムは、機械学習を用いて開発された独自のものです。機械学習に加えて、当社のアルゴリズムは以下の要素も考慮します。

  • GC 含量(25 ~ 65%)
  • 最大ホモポリマー長(< 10 塩基対)
  • 低い相同性

上記を組み合わせた結果として、特定の遺伝子配列が「Impossible」と判定されます。

野生型タンパク質の発現を維持するために:

  • レアコドン(コドン頻度が 8% 未満のもの)の使用は避けます。
  • 得られた配列の最初の 48 塩基対に強いヘアピン構造(ΔG < -8)がないことを確認します。
  • 含まないように依頼された酵素切断部位がないか、二本鎖の両方を確認します。
  • 強いシグマ 70 結合部位を作らないようにすることで、発現配列の内部にプロモーター配列を導入することを避けます。
  • リボソームと強く結合する部位となる配列(GGAGG や TAAGGAG)は避けます。
  • ターミネーター配列(TTTTT や AAAAA)となる配列は避けます。

遺伝子合成の成功率を高めるために:

  • 20 塩基対より長い反復配列は導入しない。
  • 10 塩基以上のホモポリマー配列を避ける。
  • 全体的な GC 含量が 25% 未満または 65% 超、局所領域(50 bp)の GC 含量が 35% 未満または 65% 超になるような配列を避ける。

なお、コドン最適化は合成の成功率を上げることに有効であり、タンパク質の発現向上には有効ではありません。

配列設計

はい。主に反復配列、極端な GC 含量、ホモポリマーによって合成に問題が生じる場合があります。当社では、機械学習法を用いて成功の可能性を判断しています。そのため、ほとんどの場合、配列が拒否される理由は 1 つではありません。むしろ、複雑さや受け入れ拒否の要因は、配列がある特定の複雑性のカテゴリーに分類されるような、複数の要因が組み合わさって生じます。唯一の厳格なルールは次のとおりです。

  • 14 bp 以上のホモポリマーを避ける

  • CcdB(II 型毒素–抗毒素系)を含めない

問題が発生した場合、反復、極端な GC 含量の領域、ホモポリマーを除去するか、最小限に抑えることが推奨されます。配列が複雑で構築できない場合や当社の内部プロセスと矛盾する配列が含まれている場合、当社で問題の領域を強調表示します。

遺伝子配列を当社ウェブサイト上で送信されますと、アセンブリが実行可能かを自動で判定します。

Standard: No errors have been found. 遺伝子配列は全体的に「標準的」な複雑性(長さ、GC 含量、相同性など)を持ちます。

Complex: No errors have been found. いくつかの複雑な配列(長さ、GC 含量、相同性など)が存在しますが、遺伝子合成に問題はないと考えられます。まれに、配列の納期が延びたり、合成失敗となるリスクがあります。

Error: Gene sequence contains errors. 解決方法の詳細については、その配列をクリックしてください。

Not Accepted: The sequence contains elements that make it impossible for us to synthesize. エラーメッセージの詳細をご覧になるか、「Design Guidelines(設計ガイドライン)」をご参照ください。

スコアリングシステムについて

当社のスコアリングシステムで採用している機械学習モデルでは、複数の配列パラメータ(全体の GC 含量、最大ホモポリマー長、最大リピート長、配列長、リピート密度など)を解析し組み合わせます。このモデルは、当社の過去の製造データを用いてトレーニングしたもので、遺伝子や抗体製品の合成成功率をより正確に推定することが可能です。

ISSUE メッセージについて

Warnings: Are associated with the risk of failure, predicted by the machine learning model. 警告の数が多いほど、「受け入れ不可」と判定される確率が高くなります。

Errors: Are not associated with gene complexity, and they can be fixed by correcting the gene design

注文プラットフォームでは、アミノ酸配列を受け付けると合成用の DNA 配列に変換します。配列のアップロードページで、「Amino Acid Sequence」をご選択ください。


 アミノ酸を1文字表記でご入力ください。注文プラットフォームでは、標準的な1文字コード 20 文字のみお使いいただけます。

アミノ酸配列の最後に「*」を付けると、それは終止コドンを意味します(終止コドンは自動的には追加されません)。

選択された Codon Usage Table に基づいて、最も頻繁に使用されるコドンが選択されます。

ご希望の生物種が見当たらない場合は、customersupport@twistbioscience.com までお問い合わせください。

Clonal Genes に関する注意点:すべての Twist 発現ベクターが、挿入点の上流に標準的な発現機構を備えているわけではありません。We recommend double-checking the sequence of your final plasmid construct by clicking "Download Sequences"after selecting your desired vector. 

Oligo Pools、Gene Fragments(二本鎖 DNA 断片)、Clonal Genes(プラスミド DNA)からご希望に応じてご注文可能です。

オリゴプールに含まれるオリゴヌクレオチド(直鎖状の一本鎖 DNA)の鎖長は、20 ~ 300 bp です。

Gene Fragments は、鎖長 300 ~ 5,000 bp の直鎖状の二本鎖 DNA です。

Clonal Genes は、Twist のベクターまたはお客様から提供されたカスタムベクターにクローニングした二本鎖 DNA です。Clonal Genes で合成可能なインサート鎖長は 300 ~ 5,000 bp です。

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