あらゆる規模に対応する
優れたパフォーマンス
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概要 オリゴプール New! クローニング済みオリゴプール アプリケーション 資料
概要

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

当社の革新的なシリコンベース DNA合成プラットフォームは、一つひとつが異なる 100 万超の一本鎖 DNA オリゴを一度に合成することができます。シリコンウェハー1枚に数千のクラスターが形成されており、それぞれに 121 個の独立した合成基点が用意されています。各合成基点に別々のオリゴ配列を指定して合成することが可能です。シリコンウェハー技術のイメージは下図の通りです。

シリコンウェハー上での DNA合成のスループットが非常に高いため、プールを構成するオリゴの種類の数に事実上制限はありません。用途に制限を設けることなく、お客様の実験に精密に合わせたオリゴプールをご注文ください。

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

 

より長いオリゴで、より多くのイノベーションを
 

鎖長で制限を受けることは、もうありません。より長いオリゴが含まれるオリゴプールで、プロモーター、エンハンサー、ガイド、プローブなど、必要な要素と配列をすべてコードできます。最大 300 塩基のオリゴ長により、一度の設計で複数の要素をコードすることが可能であり、より多くのことができるようになります。

 

より長いオリゴで、より多くのイノベーションを

 


一回で十分なスクリーニング結果を
 

プールの均一性が非常に高く、偏りがないため、1回のスクリーニングでより多くのターゲットを設定することができます。つまり、必要なデータカバレッジを達成するための労力を少なくでき、時間とコストの節約につながります。

一回で正確なスクリーニング

 


信頼のおける確かなデータ
 

高精度かつ高い均一性をもつTwistのオリゴプールをお使いいただくことで、実験結果の質に自信を持つことができます。合成エラーや非効率性によるデータポイントの見逃しはありません。ご希望のプールサイズで、業界トップクラスの均一性と低エラー率を誇る最大 300 塩基のオリゴをお使いください。お客様の用途で必要なだけの規模と長さで、優れた品質を持つ当社のオリゴプールをぜひご活用ください。

 

データに確信が持てる

ご不明な点はございますか?

より詳細な情報が必要な場合はお気軽にご連絡ください。当社におまかせください。

お問い合わせ

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

当社の革新的なシリコンベース DNA合成プラットフォームは、一つひとつが異なる 100 万超の一本鎖 DNA オリゴを一度に合成することができます。シリコンウェハー1枚に数千のクラスターが形成されており、それぞれに 121 個の独立した合成基点が用意されています。各合成基点に別々のオリゴ配列を指定して合成することが可能です。シリコンウェハー技術のイメージは下図の通りです。

シリコンウェハー上での DNA合成のスループットが非常に高いため、プールを構成するオリゴの種類の数に事実上制限はありません。用途に制限を設けることなく、お客様の実験に精密に合わせたオリゴプールをご注文ください。

超ハイスループットで確かなパフォーマンス

 

より長いオリゴで、より多くのイノベーションを
 

鎖長で制限を受けることは、もうありません。より長いオリゴが含まれるオリゴプールで、プロモーター、エンハンサー、ガイド、プローブなど、必要な要素と配列をすべてコードできます。最大 300 塩基のオリゴ長により、一度の設計で複数の要素をコードすることが可能であり、より多くのことができるようになります。

 

より長いオリゴで、より多くのイノベーションを

 


一回で十分なスクリーニング結果を
 

プールの均一性が非常に高く、偏りがないため、1回のスクリーニングでより多くのターゲットを設定することができます。つまり、必要なデータカバレッジを達成するための労力を少なくでき、時間とコストの節約につながります。

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信頼のおける確かなデータ
 

高精度かつ高い均一性をもつTwistのオリゴプールをお使いいただくことで、実験結果の質に自信を持つことができます。合成エラーや非効率性によるデータポイントの見逃しはありません。ご希望のプールサイズで、業界トップクラスの均一性と低エラー率を誇る最大 300 塩基のオリゴをお使いください。お客様の用途で必要なだけの規模と長さで、優れた品質を持つ当社のオリゴプールをぜひご活用ください。

 

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オリゴプール

オリゴプール
 

Twist オリゴプールは、当社のシリコンベース DNA 書き込み技術を用いて合成された高多様性の一本鎖オリゴヌクレオチド・コレクションです。当社の合成プラットフォームは、1回の合成で数十万本の高品質かつ高精度なオリゴヌクレオチドを大量に並行して生産することができます。この技術により、CRISPRスクリーニングのようなアプリケーションで用いられる、複雑で多様なオリゴプールの生成を可能にしています。

当サービスの流れ 
 

オリゴヌクレオチドの配列をご提供いただきますと、お客様ご自身がデザインされたオリゴプールライブラリが当社で合成されますので、お客様はじっくり実験や探索に取り組むことができます。

ライブラリ

優れた均一性のオリゴ合成
 

下記の図表は、23,000 個の 90 mer オリゴを含む典型的なオリゴプールの NGS を用いた品質管理データで、カバレッジ 300X でのプールの均一性を示すものです。表にはこのプールの均一性に関する指標を示しています。Twist のオリゴプールは、バイアスのない、高均一性かつ完全なオリゴによって構成されています。

オリゴヌクレオチドのリードカウント

オリゴプールの配列解析
 

Twist Bioscience のオリゴプールと、アレイベースの他社製品を配列解析した結果、 Twist オリゴプールには期待通りの配列が 100% 含まれており、他社製品よりも正確な配列の割合が高いことが実証されました。

分析


仕様
 

鎖長 20 ~ 300 塩基
オリゴプールサイズ プールサイズに制限なし
収量 各オリゴあたり 0.2 fmol 以上
均一性 90% を超えるオリゴヌクレオチドが平均値の 2.0 倍未満で存在
エラー率 最大 1 : 3000
納期 最短 5 営業日で出荷
価格 お問い合わせください

 

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オリゴプール
 

Twist オリゴプールは、当社のシリコンベース DNA 書き込み技術を用いて合成された高多様性の一本鎖オリゴヌクレオチド・コレクションです。当社の合成プラットフォームは、1回の合成で数十万本の高品質かつ高精度なオリゴヌクレオチドを大量に並行して生産することができます。この技術により、CRISPRスクリーニングのようなアプリケーションで用いられる、複雑で多様なオリゴプールの生成を可能にしています。

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優れた均一性のオリゴ合成
 

下記の図表は、23,000 個の 90 mer オリゴを含む典型的なオリゴプールの NGS を用いた品質管理データで、カバレッジ 300X でのプールの均一性を示すものです。表にはこのプールの均一性に関する指標を示しています。Twist のオリゴプールは、バイアスのない、高均一性かつ完全なオリゴによって構成されています。

オリゴヌクレオチドのリードカウント

オリゴプールの配列解析
 

Twist Bioscience のオリゴプールと、アレイベースの他社製品を配列解析した結果、 Twist オリゴプールには期待通りの配列が 100% 含まれており、他社製品よりも正確な配列の割合が高いことが実証されました。

分析


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鎖長 20 ~ 300 塩基
オリゴプールサイズ プールサイズに制限なし
収量 各オリゴあたり 0.2 fmol 以上
均一性 90% を超えるオリゴヌクレオチドが平均値の 2.0 倍未満で存在
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New! クローニング済みオリゴプール

New! クローニング済みオリゴプール

オリゴプールの品質は、実験を成功に導くための基盤となります。合成時やクローニング時のエラーにより、オリゴプールの品質は容易に変化し、目的の配列に過不足が生じます。Twist はこの度、最適化されたクローニングプロセスをご提供し、研究者の皆様における PCR 増幅条件のテストや適切なポリメラーゼ/プライマーペアの選択、さらにはクローニングワークフローの設計に伴う苦労を大きく軽減できます。Twist Bioscience にオリゴプールの合成とクローニングをお任せください。

 

当サービスの流れ 

オリゴヌクレオチドの配列をご提供いただきますと、お客様ご自身がデザインされたオリゴプールライブラリを当社で合成・クローニングしてお届けしますので、お客様はその分、じっくり実験や探索に取り組めます。

クローン

 

 

直鎖オリゴプールおよびクローニング済みオリゴプールの均一性

 

均一性

15,154 本のオリゴヌクレオチドで構成されるオリゴプールを合成して増幅し、プールの均一性、オンターゲットのオリゴヌクレオチドの割合、ドロップアウトの割合を評価しました。次に、増幅されたプールを、 Twist 独自のクローニング戦略を用いてカスタムベクターにクローニングしました。クローニング前後のプールの NGS データを比較すると、オンターゲットのオリゴヌクレオチドの割合は >96% を維持しており、ドロップアウトがなく、両者の90/10パーセンタイル比の差は 0.1 であることがわかります。
 

高品質なクローニング済みオリゴプール

 

クローン化

図 1A と図 1B は、15154 本のオリゴヌクレオチドで構成された一次オリゴプールとクローニング済みオリゴプールからそれぞれ収集されたデータをまとめたものです。これらのプロットは、各オリゴヌクレオチドの GC 含量(x 軸)に対して、それぞれのオリゴヌクレオチドのカウント(正規化、y 軸)を示しています。これにより、GC 含量に基づくオリゴヌクレオチドの偏りが限定的で、オリゴプールの数が均一に分布しており、ドロップアウトが少ないことが示されています。95/5パーセンタイルは、オリゴヌクレオチドの 90% が平均の何倍以内にあるかを示します。直鎖オリゴプール(図 1A)の場合、90% が平均値の2倍以内に収まっています。クローニング後(図 1B)、90% が平均の2倍に収まっており、 Twist のクローニングプロセスを通じてオリゴプールの品質と均一性が維持されていることがわかります。


仕様 

 

鎖長 最大 100 塩基
収量 50 μg ~
均一性 均一な合成により、優れたオリゴヌクレオチド生成率
(ターゲットの 95% 超)を実現
納期 新規ベクターの場合は 6 ~ 8 週間、Twist登録済ベクターの場合は 4 ~ 6 週間
ご不明な点はございますか?

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オリゴプールの品質は、実験を成功に導くための基盤となります。合成時やクローニング時のエラーにより、オリゴプールの品質は容易に変化し、目的の配列に過不足が生じます。Twist はこの度、最適化されたクローニングプロセスをご提供し、研究者の皆様における PCR 増幅条件のテストや適切なポリメラーゼ/プライマーペアの選択、さらにはクローニングワークフローの設計に伴う苦労を大きく軽減できます。Twist Bioscience にオリゴプールの合成とクローニングをお任せください。

 

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クローン

 

 

直鎖オリゴプールおよびクローニング済みオリゴプールの均一性

 

均一性

15,154 本のオリゴヌクレオチドで構成されるオリゴプールを合成して増幅し、プールの均一性、オンターゲットのオリゴヌクレオチドの割合、ドロップアウトの割合を評価しました。次に、増幅されたプールを、 Twist 独自のクローニング戦略を用いてカスタムベクターにクローニングしました。クローニング前後のプールの NGS データを比較すると、オンターゲットのオリゴヌクレオチドの割合は >96% を維持しており、ドロップアウトがなく、両者の90/10パーセンタイル比の差は 0.1 であることがわかります。
 

高品質なクローニング済みオリゴプール

 

クローン化

図 1A と図 1B は、15154 本のオリゴヌクレオチドで構成された一次オリゴプールとクローニング済みオリゴプールからそれぞれ収集されたデータをまとめたものです。これらのプロットは、各オリゴヌクレオチドの GC 含量(x 軸)に対して、それぞれのオリゴヌクレオチドのカウント(正規化、y 軸)を示しています。これにより、GC 含量に基づくオリゴヌクレオチドの偏りが限定的で、オリゴプールの数が均一に分布しており、ドロップアウトが少ないことが示されています。95/5パーセンタイルは、オリゴヌクレオチドの 90% が平均の何倍以内にあるかを示します。直鎖オリゴプール(図 1A)の場合、90% が平均値の2倍以内に収まっています。クローニング後(図 1B)、90% が平均の2倍に収まっており、 Twist のクローニングプロセスを通じてオリゴプールの品質と均一性が維持されていることがわかります。


仕様 

 

鎖長 最大 100 塩基
収量 50 μg ~
均一性 均一な合成により、優れたオリゴヌクレオチド生成率
(ターゲットの 95% 超)を実現
納期 新規ベクターの場合は 6 ~ 8 週間、Twist登録済ベクターの場合は 4 ~ 6 週間
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アプリケーション

CRISPRスクリーニング用のガイド RNA ライブラリ

CRISPRスクリーニングは、遺伝子活性の精密かつハイスループットなノックアウト、干渉、調節を伴うため、遺伝子型と表現型の複雑な相互作用を明らかにすることを可能とします。各遺伝子ごとに複数のガイド RNA 分子をコードするようにオリゴプールが設計されます。

製品の利点:

  • ガイドライブラリ設計を完全に制御できるため、不要なガイド、無駄なシーケンシング、遺伝子あたりのガイドの比率の制限をなくすことが可能です。
  • 高忠実性の Cas 酵素と高精度合成を組み合わせることで、オフターゲット作用を最小限に抑えた真の高忠実度スクリーニングを実現します。
  • 信じられないほど均一でバイアスのないプールにより、S/N比を増幅して最大のヒット検出を実現し、下流工程のコストを削減します。
  • 最大 300 塩基のオリゴによって、さらなる実験要素の追加を可能とします。オリゴあたりの複数のガイド、ゲノムの相同性、最小限プロモーターを簡単に追加できます。

単一細胞トランスクリプトミクスに基づく次世代CRISPRスクリーニング

こちらのウェビナーをご覧ください:Next generation CRISPR screens based on single-cell transcriptomics

ゲノムタイリングライブラリ

タイリングライブラリによって、ゲノム機能の包括的な研究が可能になります。オリゴプールは、ペプチドアレイ、 mRNA コード配列、ゲノム断片をコードできます。

製品の利点:

  • ご希望のゲノム領域を正確にタイリングします。設計段階で不要な配列を無視することにより、実験ノイズを低減します。
  • 通常は遺伝子として合成できない複雑な反復配列や回文配列もオリゴでコード化できます。
  • より大きなペプチド構造やゲノム構造は、長さ 300 塩基のオリゴにコードすることができます。
  • 均一な合成により、包括的なスクリーニングに伴うオーバーサンプリングが最小限に抑えられます。

RNAワクチン開発のためのコロナウイルス病原性因子の特定

こちらの記事をお読みください: Identifying Coronavirus Virulence Factors for RNA Vaccine Development with Twist Oligo Pools

ハイスループット遺伝子制御スクリーニング

遺伝子の発現や調節を制御する遺伝的要素の知見は、合成生物学や潜在的な疾患治療法の開発に広く応用されています。オリゴプールは、遺伝子発現のプロファイリングやレポーターを用いたアプリケーションなど、遺伝子制御のハイスループットスクリーニングを可能にします。

製品の利点:

  • 高品質のプールにより、すべての塩基の機能を調べることができます。
  • 高い均一性のため、少ないスクリーニング回数で答えを出すことが可能です。
  • 最大 300 塩基のプールにより、複数の要素や相同領域を柔軟に追加できます。

Epitranscriptome Screening on TechNetworks

こちらのウェビナーをご覧ください:Epitranscriptome Screening on TechNetworks

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション(FISH)により、生体サンプル中の核酸の存在量と空間的構成を直接可視化できます。オリゴプールは蛍光プローブをコードすることができます。蛍光プローブは、蛍光マーカーに結合すると多数のターゲットを可視化でき、それは調節可能かつプログラム可能です。

製品の利点:

  • 迅速な FISH プローブの開発
  • 配列制御により効果的なターゲット設定が可能
  • より長いオリゴでより特異的なターゲット設定が可能

Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

こちらのウェビナーをご覧ください:Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

CRISPRスクリーニング用のガイド RNA ライブラリ

CRISPRスクリーニングは、遺伝子活性の精密かつハイスループットなノックアウト、干渉、調節を伴うため、遺伝子型と表現型の複雑な相互作用を明らかにすることを可能とします。各遺伝子ごとに複数のガイド RNA 分子をコードするようにオリゴプールが設計されます。

製品の利点:

  • ガイドライブラリ設計を完全に制御できるため、不要なガイド、無駄なシーケンシング、遺伝子あたりのガイドの比率の制限をなくすことが可能です。
  • 高忠実性の Cas 酵素と高精度合成を組み合わせることで、オフターゲット作用を最小限に抑えた真の高忠実度スクリーニングを実現します。
  • 信じられないほど均一でバイアスのないプールにより、S/N比を増幅して最大のヒット検出を実現し、下流工程のコストを削減します。
  • 最大 300 塩基のオリゴによって、さらなる実験要素の追加を可能とします。オリゴあたりの複数のガイド、ゲノムの相同性、最小限プロモーターを簡単に追加できます。

単一細胞トランスクリプトミクスに基づく次世代CRISPRスクリーニング

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ゲノムタイリングライブラリ

タイリングライブラリによって、ゲノム機能の包括的な研究が可能になります。オリゴプールは、ペプチドアレイ、 mRNA コード配列、ゲノム断片をコードできます。

製品の利点:

  • ご希望のゲノム領域を正確にタイリングします。設計段階で不要な配列を無視することにより、実験ノイズを低減します。
  • 通常は遺伝子として合成できない複雑な反復配列や回文配列もオリゴでコード化できます。
  • より大きなペプチド構造やゲノム構造は、長さ 300 塩基のオリゴにコードすることができます。
  • 均一な合成により、包括的なスクリーニングに伴うオーバーサンプリングが最小限に抑えられます。

RNAワクチン開発のためのコロナウイルス病原性因子の特定

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ハイスループット遺伝子制御スクリーニング

遺伝子の発現や調節を制御する遺伝的要素の知見は、合成生物学や潜在的な疾患治療法の開発に広く応用されています。オリゴプールは、遺伝子発現のプロファイリングやレポーターを用いたアプリケーションなど、遺伝子制御のハイスループットスクリーニングを可能にします。

製品の利点:

  • 高品質のプールにより、すべての塩基の機能を調べることができます。
  • 高い均一性のため、少ないスクリーニング回数で答えを出すことが可能です。
  • 最大 300 塩基のプールにより、複数の要素や相同領域を柔軟に追加できます。

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蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション

蛍光 in-situ ハイブリダイゼーション(FISH)により、生体サンプル中の核酸の存在量と空間的構成を直接可視化できます。オリゴプールは蛍光プローブをコードすることができます。蛍光プローブは、蛍光マーカーに結合すると多数のターゲットを可視化でき、それは調節可能かつプログラム可能です。

製品の利点:

  • 迅速な FISH プローブの開発
  • 配列制御により効果的なターゲット設定が可能
  • より長いオリゴでより特異的なターゲット設定が可能

Rapid and efficient production of FISH probes using oligo pools with Nicola Crosetto

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資料
お客様の声
Twist の一本鎖 DNA オリゴプールは高い均一性と低エラー率、そして最大 300 塩基の鎖長という特徴から、 RNA でのプール作製に最適です。上記の特徴のおかげで、 RNA-低分子間相互作用のスクリーニングを高精度かつ高効率で行うことができます。
小松 リチャード 馨
代表取締役、最高技術責任者/株式会社イクスフォレストセラピューティクス
Twist オリゴプールは、我々の研究用にカスタマイズした高品質な CRISPR ライブラリを合成できる、迅速かつ便利で柔軟な方法であることが分かりました。
Stephen Pettit
研究員/がん研究所(英国)
私たちは単一塩基置換による遺伝子調節機能の同定に焦点を当てた超並列レポーターアッセイ(MPRA)に取り組んでおり、オリゴが高い忠実度を持つことは大変重要です。Twist から入手したプールをシーケンシングしたところ、変異が予想の半分ほどで、驚くほど高品質でした。
Bernie Mulvey
博士課程学生/ワシントン大学 医学部(米国ミズーリ州セントルイス)

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