Twist Respiratory Viral Research Panel

本パネルに含まれる、GenBank データベースからまとめられた 41,047 種類のプローブにより、研究者は COVID-19 の症状を、インフルエンザや別のウイルスに関連したその他の呼吸器系疾患の症状と区別することができます。Twist Respiratory Panel はこれらのウイルスの配列を濃縮し、高解像度 NGS を可能にします。これにより、難易度の高いサンプルでも、5000 倍以上の濃縮により、わずか 100 コピーのウイルス物質に対しても高感度に検出でき、濃縮後の 1X 以上のシーケンシングでゲノムの 99.9% 超のカバレッジが可能となっています。

各 Twist 合成ウイルスコントロール を、cDNA合成の前に、1,000,000 コピーで 50 ng のヒトキャリア RNA にスパイクインしました。図では、各スタンダードについて、それぞれオンターゲットのウイルスリードの割合、インプットに対する濃縮倍率、ゲノム全体のカバレッジ中央値、30x 以上のカバレッジを持つ塩基の割合、テンプレート長を示しています。ウイルスゲノムのテンプレート長は、短いものから長いものへと順に並べています。ほとんどの場合、これらのライブラリではリードの 70％ 以上がウイルスゲノムからのものであり、スパイクインしたコンテンツと比較して、少なくとも 2500 倍以上の濃縮が得られました。

こちらの図は、 Twist Synthetic Viral Controls を使用して、異なるウイルス力価で、マルチプレックスおよびシングルプレックスのハイブリダイゼーション反応を行い、オンターゲットのウイルスリードの割合を比較したものです。１つ目のグラフは ライブラリあたり 100 万コピーでハイブリダイゼーション反応を行った場合のマルチプレックスとシングルプレックスとの比較、２つ目のグラフはライブラリあたり 100、1 万、100 万コピーを用いた同様の比較を示しています。各ウイルスコントロールは、 Twist Standard Target Enrichment ワークフローと Twist Respiratory Viral Research Panel を用いてキャプチャしました。このデータは、 Twist Respiratory Viral Research Panel を使用した場合、８プレックスキャプチャはシングルプレックスキャプチャと同等の効率的な濃縮が可能であることを示しています。

Twist Respiratory Viral Research Panel では、クラウド型ツールである One Codex をご利用いただけます。研究用途や薬事未承認検査（LDT）を開発しているラボにとっても、すぐに公開できる図表や印刷可能なレポートの作成に使用することができるので、研究および臨床での使用に理想的な製品です。

Twist Respiratory Viral Research Panel をご利用の場合、すべてのお客様が One Codex 解析プラットフォームにアクセスできます。このプラットフォームは研究と臨床の両方の用途に最適で、すぐに公開できる図表や共有可能なレポート、その他の解析ツールの作成が可能です。パネルをご購入いただくと、One Codex プラットフォームでのサンプル解析の手順のご説明と各反応数相当の解析ライセンスが提供されます。この微生物サンプル解析ソリューションについての詳細は、 One Codex をご覧ください。