一般的なヒト呼吸器疾患の原因病原体を１回の検査で検出

本パネルに含まれる、GenBank データベースからまとめられた 41,047 種類のプローブにより、研究者は COVID-19 の症状を、インフルエンザや別のウイルスに関連したその他の呼吸器疾患の症状と区別することができます。Twist Respiratory Panel はこれらのウイルスの配列を濃縮し、高解像度 NGS を可能にします。これにより、難易度の高いサンプルでも、5,000 倍以上の濃縮により、わずか 100 コピーのウイルス物質に対しても高感度に検出でき、濃縮後の 1X 以上のシーケンシングでゲノムの 99.9% 超のカバレッジが可能となっています。

異なるウイルス科のウイルスコントロールの検出

Each Twist Synthetic Viral Control was spiked into 50 ng of human carrier RNA at 1,000,000 copies prior to cDNA synthesis. 図では、各スタンダードについて、それぞれオンターゲットのウイルスリードの割合、インプットに対する濃縮倍率、ゲノム全体のカバレッジ中央値、30x 以上のカバレッジを持つ塩基の割合、テンプレート長を示しています。ウイルスゲノムのテンプレート長は、短いものから長いものへと順に並べています。ほとんどの場合、これらのライブラリではリードの 70% 以上がウイルスゲノムからのものであり、スパイクインしたコンテンツと比較して、少なくとも 2,500 倍以上の濃縮が得られました。

マルチプレックスによるハイスループット化と低コスト化

こちらの図は、 Twist Synthetic Viral Controls を使用して、異なるウイルス力価で、マルチプレックスおよびシングルプレックスのハイブリダイゼーション反応を行い、オンターゲットのウイルスリードの割合を比較したものです。１つ目のグラフは ライブラリあたり 100 万コピーでハイブリダイゼーション反応を行った場合のマルチプレックスとシングルプレックスとの比較、２つ目のグラフはライブラリあたり 100、1 万、100 万コピーを用いた同様の比較を示しています。各ウイルスコントロールは、 Twist Standard Target Enrichment ワークフローと Twist Respiratory Viral Research Panel を用いてキャプチャしました。このデータは、 Twist Respiratory Viral Research Panel を使用した場合、８プレックスキャプチャはシングルプレックスキャプチャと同等の効率的な濃縮が可能であることを示しています。