Twist 呼吸器系ウイルスコントロールに含まれる各ウイルスの名称、Genbank ID、ウイルスの種類、長さ
高い再現性・正確性・安全性
Twist の Synthetic human Mpox Virus (hMPXV) Controls は、以前はサル痘として知られていた hMPXV のコンゴ盆地(CB)または西アフリカ(WA)クレードの配列に基づいており、ウイルスゲノムの 80% 超をカバーしています。その結果、これらのコントロールは、オルソポックスウイルス研究に関連するゲノム領域を標的としたカスタムアッセイの設計をサポートし、アンプリコンベースおよびキャプチャベースの両検出法に対して用いることができます。Twist の hMPXV コントロールは妥当性が確認されており、Mpox 検出のための CDC 推奨リアルタイム PCR 検査手順に適合しています。コントロール 1 とコントロール 2 はそれぞれ 154 個、151 個の重複した 1.8 kb の断片からなり、それぞれ 900 bp の間隔で配列させると Mpox ウイルスゲノムを構成します。各コントロールは約 100,000 コピー/μL の濃度で提供されます。右図は、hMPXV の WA クレードと CB クレード、および他のオルソポックスウイルスとの分類学上の関係を示したものです。詳しくは、お近くの販売代理店までお問い合わせください。
注:Twist Synthetic human Mpox Virus (hMPXV) Controls は、ISO-13485 認証を受けていません。
Pan Viral Sequencing Panel
ナイジェリアにおけるヒトサル痘ウイルスのゲノム解析
コンゴ民主共和国におけるクレード I Mpox ウイルスのゲノムの多様性、2018 年~ 2024 年:人獣共通感染症の優位性
廃水のシーケンシングから明らかになったヒト集団ウイルス群のコミュニティと変異体のダイナミクス
コンゴ民主共和国東部における新しい MPXV クレード I のヒトにおける持続的大流行
サル痘ウイルスの宿主内・宿主間ゲノム多様性
コンゴ民主共和国(DRC)における症例同定と大流行調査における Mpox マルチプレックス血清学の使用
Synthetic Controls
ポジティブコントロールを用いた品質管理
Twist は、さまざまなウイルスゲノム用に合成 RNA コントロールを作製しました。これらの変異体については、幅広い配列多様性をカバーするように選択しました。各コントロールは Twist Gene Fragments から生成され、一本鎖 RNA に転写された 6 つの非重複 5 kb 断片から構成されています。これらのコントロールにより、SARS-CoV-2 ウイルスゲノム塩基の 99.9% 超のカバレッジが得られます。ほとんどのコントロールは、100 µL 中に濃度約 100 万コピー / µL の標準フォーマットで提供しています。Twist は、乾燥ペレットとして提供されるアッセイレディタイプのコントロールおよびカプセル化コントロールもご用意しています。アッセイレディコントロールは、1 チューブあたり約 200 万コピーで提供されます。カプセル化コントロールは、1 チューブあたり約 50,000 コピーで提供されます。Twist Assay Ready Synthetic SARS-CoV-2 RNA Control は、米国 CDC と共同で開発され、A 型および B 型インフルエンザと SARS-CoV を同時に検査できる CDC インフルエンザ SARS-CoV-2 (Flu SC2)マルチプレックスアッセイに組み込まれています。この度、CDC 以外のお客様にも、Twist Assay Ready Synthetic SARS-CoV-2 RNA Control をご利用いただけるようになりました。
Twist Bioscience のカプセル化コントロール製品は、Twist が確立した合成 SARS-CoV-2 RNA コントロールのユニークな保管・配送方法の特徴を備えています。ウイルスがタンパク質の殻に包まれていることで分子をより安定に保存できるのと同様、Twist のカプセル化コントロールでは、乾燥ペレットを金属カプセルに密閉するという新しい方法を用いて RNA コントロールの安定性を高めています。安定性が増したことから、室温での出荷・保管が可能となり、コストが抑えられ、世界中で入手しやすくなりました。カプセル化コントロールは、16 本または 96 本のチューブがラックに収められた形となっており、使い切りタイプで、使用期限は製造日から 5 年間です。
アッセイレディタイプおよびカプセル化タイプそれぞれの SARS-CoV-2 コントロールの保管と使用については、以下の文書をご参照ください。
This product has not been FDA cleared or approved, but has been authorized for emergency use by FDA under an EUA for use by authorized laboratories; This product has been authorized only for the detection of nucleic acid from SARS-CoV-2, along with the identification and differentiation of SARS-CoV-2 PANGO lineages and the identification of specific SARS-CoV-2 genomic mutations, not for any other viruses or pathogens; and, the emergency use of this product is only authorized for the duration of the declaration that circumstances exist justifying the authorization of emergency use of in vitro diagnostics for detection and/or diagnosis of COVID-19 under Section 564(b)(1) of the Federal Food, Drug and Cosmetic Act, 21 U.S.C. § 360bbb-3(b)(1), unless the declaration is terminated or authorization is revoked sooner.
| 製品番号 | コントロール | GenBank/GISAID ID | GISAID 登録名 |
|---|---|---|---|
| 102019 | コントロール 1 | MT007544.1 | Australia/VIC01/2020 |
| 102024 | コントロール 2 | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 103925 | アッセイレディコントロール 2 | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 104422 | カプセル化コントロール 2(16) | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 104426 | カプセル化コントロール 2(96) | MN908947.3 | Wuhan-Hu-1 |
| 102860 | コントロール 3 | LC528232.1 | Japan/Hu_DP_Kng_19-020/2020 |
| 102862 | コントロール 4 | MT106054.1 | USA/TX1/2020 |
| 102917 | コントロール 5 | MT188340 | USA/MN2-MDH2/2020 |
| 102918 | コントロール 6 | MT118835 | USA/CA9/2020 |
| 103087 | コントロール 7 | EPI_ISL_418227 | France/HF2393/2020 |
| 103511 | コントロール 8 | MT066176 | Taiwan/NTU02/2020 |
| 103512 | コントロール 9 | MT152824 | USA/WA2/2020 |
| 103513 | コントロール 10 | EPI_ISL_414648 | USA/CA-PC101P/2020 |
| 103514 | コントロール 11 | EPI_ISL_417739 | Iceland/5/2020 |
| 103515 | コントロール 12 | EPI_ISL_420244 | England/SHEF-C05B2/2020 |
| 103533 | コントロール 13 | EPI_ISL_421184 | Belgium/ULG-10004/2020 |
| 103907 | コントロール 14 アルファ |
EPI_ISL_710528 | England/205041766/2020 |
| 103926 | アッセイレディコントロール 14 アルファ(B.1.1.7) |
EPI_ISL_710528 | England/205041766/2020 |
| 103909 | コントロール 15 アルファ |
EPI_ISL_601443 | England/MILK-9E05B3/2020 |
| 103927 |
アッセイレディコントロール 15 |
EPI_ISL_601443 | England/MILK-9E05B3/2020 |
| 104043 | コントロール 16 ベータ(B.1.351) |
EPI_ISL_678597 | South Africa/KRISP-EC-K005299/2020 |
| 104044 | コントロール 17 ガンマ(P.1) |
EPI_ISL_792683 | Japan (Brazil)/IC-0564/2021 |
| 104338 |
コントロール 18 |
EPI_ISL_1662307 | India/CT-ILSGS00361/2021 |
| 104529 |
コントロール 19 |
EPI_ISL_1300881 | USA/NY-MSHSPSP-PV24650/2020 |
| 104530 | コントロール 20 (B.1.427) |
EPI_ISL_730092 | USA/CA-ALSR-4704/2020 |
| 104531 |
コントロール 21 |
EPI_ISL_672365 | USA/CA-CZB-12943/2020 |
| 104532 | コントロール 22 (B1.1.519) |
EPI_ISL_933685 | Mexico/CMX-InDRE_208/2021 |
|
104533 |
コントロール 23 デルタ(B.1.617.2) |
EPI_ISL_1544014 | India/MH-NCCS-P1162000182735/2021 |
| 104534 | コントロール 24 (B.1.617.3) |
EPI_ISL_1939891 | India/MH-SEQ-221_S66_R1_001/2021 |
| 104538 |
コントロール 28 |
EPI_ISL_2695467 | Portugal/PT9543/2021 |
| 104423 | カプセル化コントロール 28(16) デルタ(AY.1) |
EPI_ISL_2695467 | Portugal/PT9543/2021 |
| 104427 | カプセル化コントロール 28(96) デルタ(AY.1) |
EPI_ISL_2695467 | Portugal/PT9543/2021 |
| 104539 |
コントロール 29 |
EPI_ISL_2693246 | USA/WA-CDC-UW21061750277/2021 |
| 105204 | コントロール 48 (B.1.1.529/BA.1) |
EPI_ISL_6841980 | Hong Kong/HKU-211129-001/2021 |
| 104424 | カプセル化コントロール 48(16) (B.1.1.529/BA.1) |
EPI_ISL_6841980 | Hong Kong/HKU-211129-001/2021 |
| 104428 | カプセル化コントロール 48(96) (B.1.1.529/BA.1) |
EPI_ISL_6841980 |
Hong Kong/HKU-211129-001/2021 |
| 105345 | コントロール 50 (B.1.1.529+BA.2) |
EPI_ISL_7190366 | Australia/QLD2568/2021 |
| 105346 | コントロール 51 (B.1.1.529+BA.2) |
EPI_ISL_7718520 | England/MILK-2DF642C/2021 |
| 105865 | コントロール 62 (B.2.12.1) | EPI_ISL_12248637.1 | Denmark/DCGC-493190/2022 |
| 105857 | コントロール 63 (B.2.12.1) |
EPI_ISL_12303256.1 |
USA/NY-CDC-LC0579415/2022 |
| 106196 | コントロール 64 (BA.5) | EPI_ISL_12516495 | hCoV-19/England/LSPA-3DC1269/2022 |
| 106197 | コントロール 65 (BA.5) | EPI_ISL_12620611 | hCoV-19/USA/TN-ASC-210769476/2022 |
| 106198 | コントロール 66 (BA.4) | EPI_ISL_12454576 | hCoV-19/USA/TX-HMH-M-96682/2022 |
| 106199 | コントロール 67 (BA.4) | EPI_ISL_12605687 | hCoV-19/USA/CA-CDC-QDX36065390/202 |
|
106929 |
コントロール 70 |
EPI_ISL_14829147 |
hCoV-19/USA/MI-CDC-QDX40579621/2022 |
|
106930 |
コントロール 71 |
EPI_ISL_15381979 |
hCoV-19/Australia/SA464919/2022 |
Twist Synthetic Respiratory Virus Controls は、呼吸器系疾患の研究に関連する RNA ウイルスおよび DNA ウイルスを幅広くカバーしています。これらのコントロールは、Twist Respiratory Viral Research Panel(PN 103067)に合わせて製造されており、Twist カタログパネル NGS ワークフローでの使用、またはお客様自身で設計した RT-PCR や qPCR 実験での使用に適しています。
右図は、Twist Respiratory Virus Controls でカバーされている特定のウイルスの系統樹です。各コントロールの GenBank ID、ウイルスの種類、長さを表に示しています。カスタム合成のために、その他のウイルスコントロールもご利用可能な場合があります。詳細につきましては営業担当までお問い合わせください。
ウイルス名、Genbank ID、種類、長さ
Virus name Genbank IDs, virus type, and length for each virus included in the Twist Respiratory Virus Controls. Additional viral controls may be available for custom synthesis.
詳細につきましては、営業担当までお問い合わせください。
| 型番 | 名称 | アクセッション番号 | ウイルスの種類 | 長さ(塩基) |
| 103001 | Twist Synthetic Influenza H1N1 (2009) RNA control | NC_026431、NC_026432、 NC_026433、NC_026434、 NC_026435、NC_026436、 NC_026437、NC_026438 |
一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 13158 |
| 103002 | 温度:Twist Synthetic Influenza H3N2 RNA control | NC_007366、NC_007367、 NC_007368、NC_007369、 NC_007370、NC_007371 NC_007372、NC_007373 |
一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 14452 |
| 103003 | Twist Synthetic Influenza B RNA control | NC_002204、NC_002205、 NC_002206、NC_002207、 NC_002208、NC_002209、 NC_002210、NC_002211 |
一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 14452 |
| 103004 | Twist Synthetic Human bocavirus 1 DNA Control | MG953830.1 | 一本鎖 DNA | 5164 |
| 103005 | Twist Synthetic Human enterovirus 68 RNA Control | NC_038308.1 | 一本鎖 RNA(センス鎖) | 7367 |
| 103006 | Twist Synthetic Human rhinovirus 89 RNA Control | NC_001617.1 | 一本鎖 RNA(センス鎖) | 7152 |
| 103007 | Twist Synthetic Mumps virus RNA Control | NC_002200.1 | 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 15384 |
| 103008 | Twist Synthetic Human parainfluenza virus 1 RNA Control | NC_003461.1 | 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 15600 |
| 103009 | Twist Synthetic Measles virus RNA Control | NC_001498.1 | 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 15894 |
| 103010 | Twist Synthetic Human parainfluenza virus 4 RNA Control | NC_021928.1 | 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | 17052 |
| 103011 | Twist Synthetic Human coronavirus 229E RNA Control | NC_002645.1 | 一本鎖 RNA(センス鎖) | 27317 |
| 103012 | Twist Synthetic Human coronavirus NL63 RNA Control | NC_005831.2 | 一本鎖 RNA(センス鎖) | 27553 |
| 103013 | Twist Synthetic Human coronavirus OC43 RNA Control | NC_006213.1 | 一本鎖 RNA(センス鎖) | 30741 |
| 103730 | Twist Respiratory Virus Controls (13 Count) | なし | なし | なし |
| 109012 | Twist Synthetic Influenza A (H5N1) RNA Control | OR051630.1、OR051629.1 | 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) | HA セグメント:1,695、NA セグメント:1,410 |
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