Mpox Virus Controls

Twist の Synthetic human Mpox Virus (hMPXV) Controls は、以前はサル痘として知られていた hMPXV のコンゴ盆地(CB)または西アフリカ(WA)クレードの配列に基づいており、ウイルスゲノムの 80% 超をカバーしています。その結果、これらのコントロールは、オルソポックスウイルス研究に関連するゲノム領域を標的としたカスタムアッセイの設計をサポートし、アンプリコンベースおよびキャプチャベースの両検出法に対して用いることができます。Twist の hMPXV コントロールは妥当性が確認されており、Mpox 検出のための CDC 推奨リアルタイム PCR 検査手順に適合しています。コントロール 1 とコントロール 2 はそれぞれ 154 個、151 個の重複した 1.8 kb の断片からなり、それぞれ 900 bp の間隔で配列させると Mpox ウイルスゲノムを構成します。各コントロールは約 100,000 コピー/μL の濃度で提供されます。右図は、hMPXV の WA クレードと CB クレード、および他のオルソポックスウイルスとの分類学上の関係を示したものです。詳しくは、お近くの販売代理店までお問い合わせください。

注:Twist Synthetic human Mpox Virus (hMPXV) Controls は、ISO-13485 認証を受けていません。

 

ウイルス名、Genbank ID、種類、長さ

Twist 呼吸器系ウイルスコントロールに含まれる各ウイルスの名称、Genbank ID、ウイルスの種類、長さ

関連資料

ポジティブコントロールを用いた品質管理

Twist は、さまざまなウイルスゲノム用に合成 RNA コントロールを作製しました。これらの変異体については、幅広い配列多様性をカバーするように選択しました。各コントロールは Twist Gene Fragments から生成され、一本鎖 RNA に転写された 6 つの非重複 5 kb 断片から構成されています。これらのコントロールにより、SARS-CoV-2 ウイルスゲノム塩基の 99.9% 超のカバレッジが得られます。ほとんどのコントロールは、100 µL 中に濃度約 100 万コピー / µL の標準フォーマットで提供しています。Twist は、乾燥ペレットとして提供されるアッセイレディタイプのコントロールおよびカプセル化コントロールもご用意しています。アッセイレディコントロールは、1 チューブあたり約 200 万コピーで提供されます。カプセル化コントロールは、1 チューブあたり約 50,000 コピーで提供されます。Twist Assay Ready Synthetic SARS-CoV-2 RNA Control は、米国 CDC と共同で開発され、A 型および B 型インフルエンザと SARS-CoV を同時に検査できる CDC インフルエンザ SARS-CoV-2 (Flu SC2)マルチプレックスアッセイに組み込まれています。この度、CDC 以外のお客様にも、Twist Assay Ready Synthetic SARS-CoV-2 RNA Control をご利用いただけるようになりました。

Twist Bioscience のカプセル化コントロール製品は、Twist が確立した合成 SARS-CoV-2 RNA コントロールのユニークな保管・配送方法の特徴を備えています。ウイルスがタンパク質の殻に包まれていることで分子をより安定に保存できるのと同様、Twist のカプセル化コントロールでは、乾燥ペレットを金属カプセルに密閉するという新しい方法を用いて RNA コントロールの安定性を高めています。安定性が増したことから、室温での出荷・保管が可能となり、コストが抑えられ、世界中で入手しやすくなりました。カプセル化コントロールは、16 本または 96 本のチューブがラックに収められた形となっており、使い切りタイプで、使用期限は製造日から 5 年間です。

ご利用可能な SARS-CoV-2 Controls

アッセイレディコントロールとカプセル化コントロールの使用に関するベストプラクティス

アッセイレディタイプおよびカプセル化タイプそれぞれの SARS-CoV-2 コントロールの保管と使用については、以下の文書をご参照ください。


This product has not been FDA cleared or approved, but has been authorized for emergency use by FDA under an EUA for use by authorized laboratories; This product has been authorized only for the detection of nucleic acid from SARS-CoV-2, along with the identification and differentiation of SARS-CoV-2 PANGO lineages and the identification of specific SARS-CoV-2 genomic mutations, not for any other viruses or pathogens; and, the emergency use of this product is only authorized for the duration of the declaration that circumstances exist justifying the authorization of emergency use of in vitro diagnostics for detection and/or diagnosis of COVID-19 under Section 564(b)(1) of the Federal Food, Drug and Cosmetic Act, 21 U.S.C. § 360bbb-3(b)(1), unless the declaration is terminated or authorization is revoked sooner.

製品番号 コントロール GenBank/GISAID ID GISAID 登録名
102019 コントロール 1 MT007544.1 Australia/VIC01/2020
102024 コントロール 2 MN908947.3 Wuhan-Hu-1
103925 アッセイレディコントロール 2 MN908947.3 Wuhan-Hu-1
104422 カプセル化コントロール 2(16) MN908947.3 Wuhan-Hu-1
104426 カプセル化コントロール 2(96) MN908947.3 Wuhan-Hu-1
102860 コントロール 3 LC528232.1 Japan/Hu_DP_Kng_19-020/2020
102862 コントロール 4 MT106054.1 USA/TX1/2020
102917 コントロール 5 MT188340 USA/MN2-MDH2/2020
102918 コントロール 6 MT118835 USA/CA9/2020
103087 コントロール 7 EPI_ISL_418227 France/HF2393/2020
103511 コントロール 8 MT066176 Taiwan/NTU02/2020
103512 コントロール 9 MT152824 USA/WA2/2020
103513 コントロール 10 EPI_ISL_414648 USA/CA-PC101P/2020
103514 コントロール 11 EPI_ISL_417739 Iceland/5/2020
103515 コントロール 12 EPI_ISL_420244 England/SHEF-C05B2/2020
103533 コントロール 13 EPI_ISL_421184 Belgium/ULG-10004/2020
103907 コントロール 14
アルファ
EPI_ISL_710528 England/205041766/2020
103926 アッセイレディコントロール 14
アルファ(B.1.1.7)
EPI_ISL_710528 England/205041766/2020
103909 コントロール 15
アルファ
EPI_ISL_601443 England/MILK-9E05B3/2020
103927

アッセイレディコントロール 15
アルファ(B.1.1.7)

EPI_ISL_601443 England/MILK-9E05B3/2020
104043 コントロール 16
ベータ(B.1.351)
EPI_ISL_678597 South Africa/KRISP-EC-K005299/2020
104044 コントロール 17
ガンマ(P.1)
EPI_ISL_792683 Japan (Brazil)/IC-0564/2021
104338

コントロール 18
カッパ(B.1.617.1)

EPI_ISL_1662307 India/CT-ILSGS00361/2021
104529

コントロール 19
イオタ(B.1.526)

EPI_ISL_1300881 USA/NY-MSHSPSP-PV24650/2020
104530 コントロール 20
(B.1.427)
EPI_ISL_730092 USA/CA-ALSR-4704/2020
104531

コントロール 21
イプシロン(B.1.429)

EPI_ISL_672365 USA/CA-CZB-12943/2020
104532 コントロール 22
(B1.1.519)
EPI_ISL_933685 Mexico/CMX-InDRE_208/2021

104533

コントロール 23
デルタ(B.1.617.2)
EPI_ISL_1544014 India/MH-NCCS-P1162000182735/2021
104534 コントロール 24
(B.1.617.3)
EPI_ISL_1939891 India/MH-SEQ-221_S66_R1_001/2021
104538

コントロール 28
デルタ(AY.1)

EPI_ISL_2695467 Portugal/PT9543/2021
104423 カプセル化コントロール 28(16)
デルタ(AY.1)
EPI_ISL_2695467 Portugal/PT9543/2021
104427 カプセル化コントロール 28(96)
デルタ(AY.1)
EPI_ISL_2695467 Portugal/PT9543/2021
104539

コントロール 29
デルタ(AY.2)

EPI_ISL_2693246 USA/WA-CDC-UW21061750277/2021
105204 コントロール 48
(B.1.1.529/BA.1)
EPI_ISL_6841980 Hong Kong/HKU-211129-001/2021
104424 カプセル化コントロール 48(16)
(B.1.1.529/BA.1)
EPI_ISL_6841980 Hong Kong/HKU-211129-001/2021
104428 カプセル化コントロール 48(96)
(B.1.1.529/BA.1)
EPI_ISL_6841980

Hong Kong/HKU-211129-001/2021

105345 コントロール 50
(B.1.1.529+BA.2)
EPI_ISL_7190366 Australia/QLD2568/2021
105346 コントロール 51
(B.1.1.529+BA.2)
EPI_ISL_7718520 England/MILK-2DF642C/2021
105865 コントロール 62 (B.2.12.1) EPI_ISL_12248637.1 Denmark/DCGC-493190/2022
105857 コントロール 63 (B.2.12.1)

 EPI_ISL_12303256.1

USA/NY-CDC-LC0579415/2022
106196 コントロール 64 (BA.5) EPI_ISL_12516495 hCoV-19/England/LSPA-3DC1269/2022
106197 コントロール 65 (BA.5) EPI_ISL_12620611 hCoV-19/USA/TN-ASC-210769476/2022
106198 コントロール 66 (BA.4) EPI_ISL_12454576 hCoV-19/USA/TX-HMH-M-96682/2022
106199 コントロール 67 (BA.4) EPI_ISL_12605687 hCoV-19/USA/CA-CDC-QDX36065390/202

106929

コントロール 70

EPI_ISL_14829147

hCoV-19/USA/MI-CDC-QDX40579621/2022

106930

コントロール 71

EPI_ISL_15381979

hCoV-19/Australia/SA464919/2022

ご利用可能な呼吸器系ウイルスコントロール
 

Twist Synthetic Respiratory Virus Controls は、呼吸器系疾患の研究に関連する RNA ウイルスおよび DNA ウイルスを幅広くカバーしています。これらのコントロールは、Twist Respiratory Viral Research Panel(PN 103067)に合わせて製造されており、Twist カタログパネル NGS ワークフローでの使用、またはお客様自身で設計した RT-PCR や qPCR 実験での使用に適しています。

右図は、Twist Respiratory Virus Controls でカバーされている特定のウイルスの系統樹です。各コントロールの GenBank ID、ウイルスの種類、長さを表に示しています。カスタム合成のために、その他のウイルスコントロールもご利用可能な場合があります。詳細につきましては営業担当までお問い合わせください。

ウイルス名、Genbank ID、種類、長さ

Virus name Genbank IDs, virus type, and length for each virus included in the Twist Respiratory Virus Controls. Additional viral controls may be available for custom synthesis.

詳細につきましては、営業担当までお問い合わせください。

型番 名称 アクセッション番号 ウイルスの種類 長さ(塩基)
103001 Twist Synthetic Influenza H1N1 (2009) RNA control NC_026431、NC_026432、
NC_026433、NC_026434、
NC_026435、NC_026436、
NC_026437、NC_026438
一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 13158
103002 温度:Twist Synthetic Influenza H3N2 RNA control NC_007366、NC_007367、
NC_007368、NC_007369、
NC_007370、NC_007371
NC_007372、NC_007373
一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 14452
103003 Twist Synthetic Influenza B RNA control NC_002204、NC_002205、
NC_002206、NC_002207、
NC_002208、NC_002209、
NC_002210、NC_002211
一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 14452
103004 Twist Synthetic Human bocavirus 1 DNA Control MG953830.1 一本鎖 DNA 5164
103005 Twist Synthetic Human enterovirus 68 RNA Control NC_038308.1 一本鎖 RNA(センス鎖) 7367
103006 Twist Synthetic Human rhinovirus 89 RNA Control NC_001617.1 一本鎖 RNA(センス鎖) 7152
103007 Twist Synthetic Mumps virus RNA Control NC_002200.1 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 15384
103008 Twist Synthetic Human parainfluenza virus 1 RNA Control NC_003461.1 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 15600
103009 Twist Synthetic Measles virus RNA Control NC_001498.1 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 15894
103010 Twist Synthetic Human parainfluenza virus 4 RNA Control NC_021928.1 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) 17052
103011 Twist Synthetic Human coronavirus 229E RNA Control NC_002645.1 一本鎖 RNA(センス鎖) 27317
103012 Twist Synthetic Human coronavirus NL63 RNA Control NC_005831.2 一本鎖 RNA(センス鎖) 27553
103013 Twist Synthetic Human coronavirus OC43 RNA Control NC_006213.1 一本鎖 RNA(センス鎖) 30741
103730 Twist Respiratory Virus Controls (13 Count) なし なし なし
109012 Twist Synthetic Influenza A (H5N1) RNA Control OR051630.1、OR051629.1 一本鎖 RNA (アンチセンス鎖) HA セグメント:1,695、NA セグメント:1,410

   Taking Control In H5N1 Bird Flu Research With Synthetic DNA                                                                                                                                     Read more

Respiratory Virus Controls                                                                                                                                                                                                      Download

Twist Synthetic Infectious Disease Controls Product List                                                                                                                                                         Download

Synthetic SARS-CoV-2 Control Variant Information                                                                                                                                                                   Download

Synthetic SARS-CoV-2 RNA Controls                                                                                                                                                                                         Download

NGS を用いた SARS-CoV-2 の検出・特性解析用ターゲットキャプチャ
Twist Respiratory Viral Research Panel を用いたウイルス病原体の NGS ターゲットエンリッチメント

Twist Assay Ready Synthetic Controls

Twist SARS-CoV-2 Encapsulated RNA Control の保管・取扱いガイド
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