Twist Human Methylome Panel は、123 Mb のゲノムコンテンツを通じて、ゲノム上の 398 万の CpG 部位を対象として生物学的に重要なメチル化マーカーを探索するためのものです。本パネルは、がん転移、ヒトの発生、機能ゲノミクスなど、多様な用途においてメチル化分画を探索する研究者にとって理想的な選択肢となる、さまざまなコンテンツを有しています。
本パネルは、 Twist NGSメチル化検出システムとの併用に最適化・検証されており、業界をリードするパフォーマンスで完全なエンドツーエンドのワークフローを実現します。高いキャプチャ効率により、エピゲノムのフットプリント全域で検出感度が向上し、かつシーケンシングのコストを削減します。本パネルは、コホートサンプルのスクリーニングやさまざまなメチル化領域の探索に最適です。
メチル化解析のため、高度に複雑で均一なシーケンスリードを生成する完全なソリューションです。革新的な酵素変換プロセス、最適化されたターゲットエンリッチメントワークフロー、高度なパネルデザインプロセスを組み合わせることにより、エンドツーエンドプロトコルを実現します。
Twist Human Methylome Panel は、123 Mb のゲノムコンテンツを通じて、ゲノム上の 398 万の CpG 部位を対象として生物学的に重要なメチル化マーカーを探索するためのものです。本パネルは、がん転移、ヒトの発生、機能ゲノミクスなど、多様な用途においてメチル化分画を探索する研究者にとって理想的な選択肢となる、さまざまなコンテンツを有しています。
本パネルは、 Twist NGSメチル化検出システムとの併用に最適化・検証されており、業界をリードするパフォーマンスで完全なエンドツーエンドのワークフローを実現します。高いキャプチャ効率により、エピゲノムのフットプリント全域で検出感度が向上し、かつシーケンシングのコストを削減します。本パネルは、コホートサンプルのスクリーニングやさまざまなメチル化領域の探索に最適です。
メチル化解析のため、高度に複雑で均一なシーケンスリードを生成する完全なソリューションです。革新的な酵素変換プロセス、最適化されたターゲットエンリッチメントワークフロー、高度なパネルデザインプロセスを組み合わせることにより、エンドツーエンドプロトコルを実現します。
Twist Human Methylome には、生物学的に重要なメチル化マーカーを標的とする 123 Mb のゲノムコンテンツを通して、398 万の CpG 部位が含まれています。本パネルは、ゲノムに含まれる最新かつアノテーション付きで重要な CpG メチル化領域のキャプチャおよび検出に特化しています。ゲノムの CpG アイランドの 84%(17,915,988)が、このパネルを用いたエンリッチメントで同定されます。その後に続く CpG shores、shelves、open seaのさらなる 105,288,339 塩基と塩基対がカバーされています。カバレッジの重複は、アレイカバレッジデータファイルと比較したシャドウ・カバレッジを含めて、カバレッジの社内実験データから決定されます。

マイクロアレイは静的コンテンツで設計されているため、新たなエピゲノム標的の発見を妨げる可能性があります。また、現在市販されているアレイは、エピゲノム全体のメチロームに対するカバレッジが低く、多くのメチル化 CpG 部位が測定されないままになります。Twist Human Methylome ターゲットエンリッチメントのアプローチは、 NGS プラットフォームが提供するシーケンスリード全体にわたって、コンテンツの拡張と1塩基解像度を可能にするハイブリッドキャプチャパネルによって、そうした制限に対処します。
マイクロアレイは、低域ではバックグラウンドノイズが大きく、高域ではシグナルが飽和するため、メチル化検出における両極端に固有の限界があります。NGS のダイナミックレンジの高さにより、 Twist Human Methylome Panel は、特にメチル化分画の低域と高域の両方で、メチル化差異領域(DMR)をより正確にコーリングすることが可能です。

Twist Human Methylome Panel は、正確で高感度、高パフォーマンスのハイブリッドキャプチャ効率を提供するために設計され、ウェットラボに最適化されています。本パネルは、カバレッジ 30X で塩基の 90% をカバーするカバレッジ深度と、オンターゲット率 95% という高いプローブ特異性を実現しています。また、1.54 という fold 80 値を実現し、ベースコールの山谷の差分を小さくすることでターゲット領域全体に高い均一性を実現しています。逆に、カバレッジ 150x(正規化前)という高いシーケンシング深度でduplication率が 4% 未満であり、ライブラリの複雑性が示されました。パネルの全体的なキャプチャ効率の指標は、最小限のシーケンシングコストで、メチル化分画全体の検出において高い信頼性を示しています。

Twist Human Methylome には、生物学的に重要なメチル化マーカーを標的とする 123 Mb のゲノムコンテンツを通して、398 万の CpG 部位が含まれています。本パネルは、ゲノムに含まれる最新かつアノテーション付きで重要な CpG メチル化領域のキャプチャおよび検出に特化しています。ゲノムの CpG アイランドの 84%(17,915,988)が、このパネルを用いたエンリッチメントで同定されます。その後に続く CpG shores、shelves、open seaのさらなる 105,288,339 塩基と塩基対がカバーされています。カバレッジの重複は、アレイカバレッジデータファイルと比較したシャドウ・カバレッジを含めて、カバレッジの社内実験データから決定されます。

マイクロアレイは静的コンテンツで設計されているため、新たなエピゲノム標的の発見を妨げる可能性があります。また、現在市販されているアレイは、エピゲノム全体のメチロームに対するカバレッジが低く、多くのメチル化 CpG 部位が測定されないままになります。Twist Human Methylome ターゲットエンリッチメントのアプローチは、 NGS プラットフォームが提供するシーケンスリード全体にわたって、コンテンツの拡張と1塩基解像度を可能にするハイブリッドキャプチャパネルによって、そうした制限に対処します。
マイクロアレイは、低域ではバックグラウンドノイズが大きく、高域ではシグナルが飽和するため、メチル化検出における両極端に固有の限界があります。NGS のダイナミックレンジの高さにより、 Twist Human Methylome Panel は、特にメチル化分画の低域と高域の両方で、メチル化差異領域(DMR)をより正確にコーリングすることが可能です。

Twist Human Methylome Panel は、正確で高感度、高パフォーマンスのハイブリッドキャプチャ効率を提供するために設計され、ウェットラボに最適化されています。本パネルは、カバレッジ 30X で塩基の 90% をカバーするカバレッジ深度と、オンターゲット率 95% という高いプローブ特異性を実現しています。また、1.54 という fold 80 値を実現し、ベースコールの山谷の差分を小さくすることでターゲット領域全体に高い均一性を実現しています。逆に、カバレッジ 150x(正規化前)という高いシーケンシング深度でduplication率が 4% 未満であり、ライブラリの複雑性が示されました。パネルの全体的なキャプチャ効率の指標は、最小限のシーケンシングコストで、メチル化分画全体の検出において高い信頼性を示しています。

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Twist Human Methylome Panel, 2 Reactions105520
Twist Human Methylome Panel, 12 Reactions105521
Twist Human Methylome Panel, 96 Reactions105517
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