妥協は必要ありません
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概要 データ 注文・仕様 資料
概要

エクソームシーケンスが臨床と診断の両方で広く使用されるようになりました。Twist Human Core Exome は、タンパク質をコードする遺伝子のシーケンス解析に最適なソリューションを提供します。ただし Twist Human Core Exome は、最も正確に収集されたサブセットである CCDS データベースのみに焦点を当てています。Twist は、 Twist Human Core Exome のコンテンツを拡張するために設計された、 Twist Human RefSeq Panel を提供することになりました。この2つのパネルを組み合わせることで、タンパク質をコードする遺伝子の 99% 以上をカバーすることができます。

自信を深める
より完全なカバレッジ
タンパク質をコードするすべての遺伝子をターゲットとするため、3.6 Mb のコンテンツを追加
データベースの最新のリリースに基づく設計
柔軟性を保つ
柔軟性を保つ
コアエクソームパネルにコンテンツを簡単にスパイクイン可能
シングルプレックスおよびマルチプレックスターゲットエンリッチメントワークフローの両方で効果的
効率の最大化
効率の最大化
そのまま使用できる構成
優れたカバレッジの均一性により、サンプルあたりのシーケンスコストを削減
ダウンロードする

エクソームシーケンスが臨床と診断の両方で広く使用されるようになりました。Twist Human Core Exome は、タンパク質をコードする遺伝子のシーケンス解析に最適なソリューションを提供します。ただし Twist Human Core Exome は、最も正確に収集されたサブセットである CCDS データベースのみに焦点を当てています。Twist は、 Twist Human Core Exome のコンテンツを拡張するために設計された、 Twist Human RefSeq Panel を提供することになりました。この2つのパネルを組み合わせることで、タンパク質をコードする遺伝子の 99% 以上をカバーすることができます。

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自信を深める
より完全なカバレッジ
タンパク質をコードするすべての遺伝子をターゲットとするため、3.6 Mb のコンテンツを追加
データベースの最新のリリースに基づく設計
柔軟性を保つ
柔軟性を保つ
コアエクソームパネルにコンテンツを簡単にスパイクイン可能
シングルプレックスおよびマルチプレックスターゲットエンリッチメントワークフローの両方で効果的
効率の最大化
効率の最大化
そのまま使用できる構成
優れたカバレッジの均一性により、サンプルあたりのシーケンスコストを削減
データ
バリアント検出実験の信頼性を高める

遺伝子の定義は、大規模実験から得られた新しい情報に基づいて GENCODE など専門のコンソーシアムによって常に更新されています。したがって、数年前の定義に基づいたパネルでは遺伝子のかなりの部分が欠落し、古い配列が含まれている可能性があります。

 

NGS Fixed Panel RefSeq データベース表
最大のシーケンス効率と最高のカバレッジ均一性

Twist は、標準プロトコルの優れたパフォーマンスをわずか 15 分間で提供できる、Fast Hybridization ソリューションを開発しました。この迅速なハイブリダイゼーションによって合理化されたターゲットエンリッチメントのワークフローは 5 ~ 8 時間(ライブラリ調製時間を含めて)で完了可能で、その日のうちにサンプルをシーケンサーにかけることができます。

Fast Hybridization ソリューションを用いたワークフローは、1本のチューブだけを用いて乾燥を行い、ハイスループットアプリケーションに対応するための全自動化が可能です。

ここでは、 Twist Human Core Exomeキットおよび Core Exome + Twist Human RefSeq Panel と市販されている同等のキットで、ターゲットカバレッジおよび Fold-80 を比較して示しています。それぞれの図で示されているように、ターゲットカバレッジ (>94%) と Fold-80 (1.34 ~ 1.36) は、市販されている同等キットと比較して、Exome のみでも Exome + RefSeq Panel でもはるかに優れています。
 

 

NGS Fixed Panel RefSeqターゲットカバレッジ Fold80グラフ
Twist ターゲットエンリッチメントを使用して簡単にコンテンツを追加

Twistは、お客様が必要なターゲットをカバーできるソリューションを提供していますが、Twist Human Core Exome+Twist Human RefSeqパネルのような拡張コンテンツパネルもその一つです。

NGS Fixed Panel RefSeq カスタム化
バリアント検出実験の信頼性を高める

遺伝子の定義は、大規模実験から得られた新しい情報に基づいて GENCODE など専門のコンソーシアムによって常に更新されています。したがって、数年前の定義に基づいたパネルでは遺伝子のかなりの部分が欠落し、古い配列が含まれている可能性があります。

 

NGS Fixed Panel RefSeq データベース表
最大のシーケンス効率と最高のカバレッジ均一性

Twist は、標準プロトコルの優れたパフォーマンスをわずか 15 分間で提供できる、Fast Hybridization ソリューションを開発しました。この迅速なハイブリダイゼーションによって合理化されたターゲットエンリッチメントのワークフローは 5 ~ 8 時間(ライブラリ調製時間を含めて)で完了可能で、その日のうちにサンプルをシーケンサーにかけることができます。

Fast Hybridization ソリューションを用いたワークフローは、1本のチューブだけを用いて乾燥を行い、ハイスループットアプリケーションに対応するための全自動化が可能です。

ここでは、 Twist Human Core Exomeキットおよび Core Exome + Twist Human RefSeq Panel と市販されている同等のキットで、ターゲットカバレッジおよび Fold-80 を比較して示しています。それぞれの図で示されているように、ターゲットカバレッジ (>94%) と Fold-80 (1.34 ~ 1.36) は、市販されている同等キットと比較して、Exome のみでも Exome + RefSeq Panel でもはるかに優れています。
 

 

NGS Fixed Panel RefSeqターゲットカバレッジ Fold80グラフ
Twist ターゲットエンリッチメントを使用して簡単にコンテンツを追加

Twistは、お客様が必要なターゲットをカバーできるソリューションを提供していますが、Twist Human Core Exome+Twist Human RefSeqパネルのような拡張コンテンツパネルもその一つです。

NGS Fixed Panel RefSeq カスタム化
注文・仕様
製品 SKU

102028

Twist Human RefSeq Panel, 2 Reactions, Kit Panel for 2 enrichment reactions targeting 3.6 Mb of human protein coding regions

102029

Twist Human RefSeq Panel, 12 Reactions, Kit Panel for 12 enrichment reactions targeting 3.6 Mb of human protein coding regions

102030

Twist Human RefSeq Panel, 96 Reactions, Kit Panel for 96 enrichment reactions targeting 3.6 Mb of human protein coding regions
仕様

ワークフローステップ

ターゲットエンリッチメント

形式

dsDNA

パネルサイズ

3.6 Mb

コンテンツ

タンパク質をコードする遺伝子

設計データベース

CCDS、RefSeq、GENCODE、UCSC

ヒトリファレンスゲノム

hg38

保管条件

-5 ℃から-30 ℃で保存

Twist Human RefSeq Panel は研究専用であり、 Twist の供給規約と条件で規定されている追加の使用制限が適用されます。

製品 SKU

102028

Twist Human RefSeq Panel, 2 Reactions, Kit Panel for 2 enrichment reactions targeting 3.6 Mb of human protein coding regions

102029

Twist Human RefSeq Panel, 12 Reactions, Kit Panel for 12 enrichment reactions targeting 3.6 Mb of human protein coding regions

102030

Twist Human RefSeq Panel, 96 Reactions, Kit Panel for 96 enrichment reactions targeting 3.6 Mb of human protein coding regions
仕様

ワークフローステップ

ターゲットエンリッチメント

形式

dsDNA

パネルサイズ

3.6 Mb

コンテンツ

タンパク質をコードする遺伝子

設計データベース

CCDS、RefSeq、GENCODE、UCSC

ヒトリファレンスゲノム

hg38

保管条件

-5 ℃から-30 ℃で保存

Twist Human RefSeq Panel は研究専用であり、 Twist の供給規約と条件で規定されている追加の使用制限が適用されます。

資料