新種のウイルスの発見
新種のウイルスの発見
新種のウイルスの発見
概要 データ データ解析 注文・仕様 資料
概要

新種のウイルスの発見

The pandemic emergence of SARS-CoV-2 along with the monkeypox outbreak highlight the need for improved tools for detecting and surveilling novel viral pathogens.

Twist Comprehensive Viral Research Panel は、さまざまな種類のサンプル中の新規ウイルスや高度に進化したウイルスを迅速に同定し、その特性を明らかにするための完全なターゲットエンリッチメントソリューションです。

検出
新種のウイルスの網羅的な検出
3,153種のウイルスゲノムをターゲットにした100万種類以上の固有のプローブ
ssDNA、dsDNA、dsRNA、ssRNAの異なるウイルス種をキャプチャ
ウイルス発見
新規変異体の発見
ウイルス性のヒト病原体および非ヒト病原体を網羅したパネルデザイン
長いプローブでの高いミスマッチ許容性を新規および変異型ウイルス種の発見に有用
スクリーニング
エンドツーエンドのウイルススクリーニングソリューション
One Codexによる分かりやすい解析
データレポートと論文用の図表をすばやく作成
進化した新種のウイルスの検出

Twist Comprehensive Viral Research Panelは、15,488種の異なる株を含む3,153種のウイルスの参照配列を網羅しています。
検出可能なウイルスの例:

アデノウイルス

コロナウイルス

ヘルペスウイルス

インフルエンザA型・B型

Monkeypox

ノロウイルス

パピローマウイルス

パルボウイルス

ピコルナウイルス

ポックスウイルス

レトロウイルス

ラブドウイルス
 

ここから全てのウイルスファミリーを参照

新種のウイルスの発見

The pandemic emergence of SARS-CoV-2 along with the monkeypox outbreak highlight the need for improved tools for detecting and surveilling novel viral pathogens.

Twist Comprehensive Viral Research Panel は、さまざまな種類のサンプル中の新規ウイルスや高度に進化したウイルスを迅速に同定し、その特性を明らかにするための完全なターゲットエンリッチメントソリューションです。

検出
新種のウイルスの網羅的な検出
3,153種のウイルスゲノムをターゲットにした100万種類以上の固有のプローブ
ssDNA、dsDNA、dsRNA、ssRNAの異なるウイルス種をキャプチャ
ウイルス発見
新規変異体の発見
ウイルス性のヒト病原体および非ヒト病原体を網羅したパネルデザイン
長いプローブでの高いミスマッチ許容性を新規および変異型ウイルス種の発見に有用
スクリーニング
エンドツーエンドのウイルススクリーニングソリューション
One Codexによる分かりやすい解析
データレポートと論文用の図表をすばやく作成
進化した新種のウイルスの検出

Twist Comprehensive Viral Research Panelは、15,488種の異なる株を含む3,153種のウイルスの参照配列を網羅しています。
検出可能なウイルスの例:

アデノウイルス

コロナウイルス

ヘルペスウイルス

インフルエンザA型・B型

Monkeypox

ノロウイルス

パピローマウイルス

パルボウイルス

ピコルナウイルス

ポックスウイルス

レトロウイルス

ラブドウイルス
 

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データ
新種のウイルスの網羅的な検出

Twist Comprehensive Viral Research Panelは、RefSeq、FluDB、VIPRデータベースから参照配列を収集し、1,052,421種類の固有のプローブで構成するように設計しました。

このパネルは、アデノウイルス、コロナウイルス、フラビウイルス、ノロウイルス、インフルエンザウイルスなど、ヒトに感染することが知られているウイルスを少なくとも1 つ含む、全てのウイルス科に対応しています。

またこのパネルは、ヒトに感染するウイルスだけでなく、動物に感染するウイルス(コウモリコロナウイルスなど)もターゲットとしています。これにより、起源に関係なく、新しいウイルス種を発見することができます。

この多様なTwist Comprehensive Viral Research Panelを用いることで、2020年6月に養豚関係者の間で発生したH1N1インフルエンザに関連するウイルス株など、新規および進化した株を検出することができます。

新種のウイルスの網羅的な検出
極めて多様なウイルス配列の検出

動物におけるコロナウイルスのスパイクおよびインフルエンザヘマグルチニン(HA)糖タンパク質の自然淘汰は、SARS-CoV-2およびH1N1インフルエンザの人獣共通感染を促進しました。

こちらの表では、Twist Comprehensive Viral Research Panelを使用することで、最近発見されたコロナウイルス(RoBat-CoV GCCDC1 Singapore)のスパイク領域や2020年6月に養豚関係者間で発生したH1N1インフルエンザから単離されたHAセグメントなど、キャプチャが難しいシーケンスをうまく検出できることを示しています。

Twistのパネルは、1x以上でのカバレッジで各シーケンスの99.8%以上を検出しました。
 

極めて多様なウイルス配列の検出
新型ウイルスのエンリッチメント

野生型のHAセグメントを5%から30%の範囲で設定した変異配列を含む一連のHAセグメントを用いて、Twist Comprehensive Viral Research Panelのミスマッチ許容性を決定しました。

最大10%の配列変異を含むサンプルについて、トータルで1xでの完全なカバレッジを得ました。これらのデータを合わせると、Twist Comprehensive Viral Research Panelが高度に進化したウイルス配列をキャプチャできることがわかります。

新型ウイルスのエンリッチメント
多様なウイルスを同時検出

Twist Comprehensive Viral Research Panelを使用すると、複数のウイルスを一度に検出することが可能で、様々なサンプルタイプにおけるメタゲノミクスへの応用に使用できます。

多重感染のアッセイとして、このパネルでは、わずか 120 万リードで、ヒトRNAに添加(スパイクイン)した4種類の異なるウイルス(アストロウイルス:ssRNA、BK ウイルス:dsDNA、ボカウイルス:ssDNA、およびピコビルナウイルス:dsRNA)全てを検出しました。
 

多様なウイルスを同時検出
新種のウイルスの網羅的な検出

Twist Comprehensive Viral Research Panelは、RefSeq、FluDB、VIPRデータベースから参照配列を収集し、1,052,421種類の固有のプローブで構成するように設計しました。

このパネルは、アデノウイルス、コロナウイルス、フラビウイルス、ノロウイルス、インフルエンザウイルスなど、ヒトに感染することが知られているウイルスを少なくとも1 つ含む、全てのウイルス科に対応しています。

またこのパネルは、ヒトに感染するウイルスだけでなく、動物に感染するウイルス(コウモリコロナウイルスなど)もターゲットとしています。これにより、起源に関係なく、新しいウイルス種を発見することができます。

この多様なTwist Comprehensive Viral Research Panelを用いることで、2020年6月に養豚関係者の間で発生したH1N1インフルエンザに関連するウイルス株など、新規および進化した株を検出することができます。

新種のウイルスの網羅的な検出
極めて多様なウイルス配列の検出

動物におけるコロナウイルスのスパイクおよびインフルエンザヘマグルチニン(HA)糖タンパク質の自然淘汰は、SARS-CoV-2およびH1N1インフルエンザの人獣共通感染を促進しました。

こちらの表では、Twist Comprehensive Viral Research Panelを使用することで、最近発見されたコロナウイルス(RoBat-CoV GCCDC1 Singapore)のスパイク領域や2020年6月に養豚関係者間で発生したH1N1インフルエンザから単離されたHAセグメントなど、キャプチャが難しいシーケンスをうまく検出できることを示しています。

Twistのパネルは、1x以上でのカバレッジで各シーケンスの99.8%以上を検出しました。
 

極めて多様なウイルス配列の検出
新型ウイルスのエンリッチメント

野生型のHAセグメントを5%から30%の範囲で設定した変異配列を含む一連のHAセグメントを用いて、Twist Comprehensive Viral Research Panelのミスマッチ許容性を決定しました。

最大10%の配列変異を含むサンプルについて、トータルで1xでの完全なカバレッジを得ました。これらのデータを合わせると、Twist Comprehensive Viral Research Panelが高度に進化したウイルス配列をキャプチャできることがわかります。

新型ウイルスのエンリッチメント
多様なウイルスを同時検出

Twist Comprehensive Viral Research Panelを使用すると、複数のウイルスを一度に検出することが可能で、様々なサンプルタイプにおけるメタゲノミクスへの応用に使用できます。

多重感染のアッセイとして、このパネルでは、わずか 120 万リードで、ヒトRNAに添加(スパイクイン)した4種類の異なるウイルス(アストロウイルス:ssRNA、BK ウイルス:dsDNA、ボカウイルス:ssDNA、およびピコビルナウイルス:dsRNA)全てを検出しました。
 

多様なウイルスを同時検出
データ解析
One Codex解析

Twist Comprehensive Viral Research Panelには、ウェブ解析ツールであるOne Codexへのアクセス権が含まれています。このクラウドベースのツールは、解析のサポートだけでなく、レポートや論文用の図表を抽出できるため、新しいウイルス発見の取り組みを記録することもできます。

One Codexを用いることで、Twist Comprehensive Viral Research Panelで得られた配列データをより簡単に解析できます。簡単で操作性の高いインターフェースで配列データをアップロードすると、数分後には新しいウイルス発見の結果をまとめたレポートを作成することができます。また、お客様独自の検出閾値や解釈を用いてバイオインフォマティクスのワークフローをカスタマイズすることができます。

Twist Comprehensive Viral Research Panelを購入すると、クーポンコードや詳細な手順など、One Codexで結果を解析するために必要なものがすべて揃っています。この効率的な微生物解析プラットフォームの詳細についてはonecodex.comをご覧ください。
 

One Codex解析
One Codex解析

Twist Comprehensive Viral Research Panelには、ウェブ解析ツールであるOne Codexへのアクセス権が含まれています。このクラウドベースのツールは、解析のサポートだけでなく、レポートや論文用の図表を抽出できるため、新しいウイルス発見の取り組みを記録することもできます。

One Codexを用いることで、Twist Comprehensive Viral Research Panelで得られた配列データをより簡単に解析できます。簡単で操作性の高いインターフェースで配列データをアップロードすると、数分後には新しいウイルス発見の結果をまとめたレポートを作成することができます。また、お客様独自の検出閾値や解釈を用いてバイオインフォマティクスのワークフローをカスタマイズすることができます。

Twist Comprehensive Viral Research Panelを購入すると、クーポンコードや詳細な手順など、One Codexで結果を解析するために必要なものがすべて揃っています。この効率的な微生物解析プラットフォームの詳細についてはonecodex.comをご覧ください。
 

One Codex解析
注文・仕様
製品SKU

103545

Twist Comprehensive Viral Research Panel with One Codex software, 2 Reactions, Kit

103547

Twist Comprehensive Viral Research Panel with One Codex software, 12 Reactions, Kit

103458

Twist Comprehensive Viral Research Panel with One Codex software, 96 Reactions, Kit
仕様

ワークフローステップ

ターゲットエンリッチメント

フォーマット

dsDNA

パネルサイズ

36.8 Mb

コンテンツ

ウイルス配列

設計データベース

FluDB、RefSeq、VIPRdb

保管条件

-5から-30℃で保存
製品SKU

103545

Twist Comprehensive Viral Research Panel with One Codex software, 2 Reactions, Kit

103547

Twist Comprehensive Viral Research Panel with One Codex software, 12 Reactions, Kit

103458

Twist Comprehensive Viral Research Panel with One Codex software, 96 Reactions, Kit
仕様

ワークフローステップ

ターゲットエンリッチメント

フォーマット

dsDNA

パネルサイズ

36.8 Mb

コンテンツ

ウイルス配列

設計データベース

FluDB、RefSeq、VIPRdb

保管条件

-5から-30℃で保存
資料