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概要 データ 注文情報 資料
概要

リキッドバイオプシー研究用の包括的がんバリアントリファレンススタンダード

 

次世代シーケンシング( NGS )を用いたリキッドバイオプシーは急速に発展しているアプリケーションであり、正確かつ高精度のリファレンススタンダードを必要としています。Twist Pan-cancer(汎がん)リファレンススタンダードは、 NGS を用いたリキッドバイオプシーアッセイの研究開発に使用するための、高品質で標準化されたコントロールです。このリファレンススタンダードは、特定のがんバリアントの検出限界(LoD)の確立や、アッセイの研究開発において NGSアッセイのワークフローの品質を追跡し、アッセイ手順が忠実に実施されているかを評価するためのコントロールとして理想的です。
 

従来のリファレンススタンダードはバリアントの数や多様性が限られており、不要な配列変異や断片長の変動が認められ得る細胞株由来 DNA が通常用いられています。Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダードには、研究用に広範で多様な一連のバリアントが組み込まれています。このリファレンススタンダードは、特定のバリアントのアレル頻度(VAF)を精密に制御した正確なバリアントDNA合成により、セルフリー DNA および循環腫瘍 DNA のサイズ分布および断片化プロファイルを厳密に模倣したスタンダードとなっており、高性能のアッセイ開発が可能です。
 

このリファレンススタンダードは、循環腫瘍 DNA (ctDNA)を模倣して合成されたバリアント配列と、ヒト由来セルフリー DNA (cfDNA)に由来し、cfDNA を厳密に模倣しているバックグラウンド DNA との組み合わせで構成されています。ctDNA 配列は約 167 bp の配列をタイル状に並べたプールとして設計されており、ネイティブな ctDNA を厳密に模倣し、84 種類のがん関連遺伝子にわたる 458 種類の変異(臨床的に対処可能な 132 種類のバリアントを含む)をカバーしています。

 

がんバリアントの包括的な検出
がんバリアントの包括的な検出
458 種類の自然発生がんバリアント
臨床的に関連のある 132 種類のバリアント
がんに関与する 84 種類の遺伝子をカバー
バックグラウンド DNA のより良い設計
バックグラウンド DNA のより良い設計
ヒト cfDNA サンプルに由来するバックグラウンド DNA
DNA サイズおよびシーケンシング後のプロファイルはネイティブな cfDNA を模倣
精度と柔軟性を追求した設計
精度と柔軟性を追求した設計
7種類の VAF パーセンテージから選択可能
VAF パーセンテージの Digital Droplet PCR による検証
すべての VAF パーセンテージを含む便利なセットも利用可能

※ 研究専用です。診断や臨床に使用することはできません。

お問い合わせ
 

リキッドバイオプシー研究用の包括的がんバリアントリファレンススタンダード

 

次世代シーケンシング( NGS )を用いたリキッドバイオプシーは急速に発展しているアプリケーションであり、正確かつ高精度のリファレンススタンダードを必要としています。Twist Pan-cancer(汎がん)リファレンススタンダードは、 NGS を用いたリキッドバイオプシーアッセイの研究開発に使用するための、高品質で標準化されたコントロールです。このリファレンススタンダードは、特定のがんバリアントの検出限界(LoD)の確立や、アッセイの研究開発において NGSアッセイのワークフローの品質を追跡し、アッセイ手順が忠実に実施されているかを評価するためのコントロールとして理想的です。
 

従来のリファレンススタンダードはバリアントの数や多様性が限られており、不要な配列変異や断片長の変動が認められ得る細胞株由来 DNA が通常用いられています。Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダードには、研究用に広範で多様な一連のバリアントが組み込まれています。このリファレンススタンダードは、特定のバリアントのアレル頻度(VAF)を精密に制御した正確なバリアントDNA合成により、セルフリー DNA および循環腫瘍 DNA のサイズ分布および断片化プロファイルを厳密に模倣したスタンダードとなっており、高性能のアッセイ開発が可能です。
 

このリファレンススタンダードは、循環腫瘍 DNA (ctDNA)を模倣して合成されたバリアント配列と、ヒト由来セルフリー DNA (cfDNA)に由来し、cfDNA を厳密に模倣しているバックグラウンド DNA との組み合わせで構成されています。ctDNA 配列は約 167 bp の配列をタイル状に並べたプールとして設計されており、ネイティブな ctDNA を厳密に模倣し、84 種類のがん関連遺伝子にわたる 458 種類の変異(臨床的に対処可能な 132 種類のバリアントを含む)をカバーしています。

 

がんバリアントの包括的な検出
がんバリアントの包括的な検出
458 種類の自然発生がんバリアント
臨床的に関連のある 132 種類のバリアント
がんに関与する 84 種類の遺伝子をカバー
バックグラウンド DNA のより良い設計
バックグラウンド DNA のより良い設計
ヒト cfDNA サンプルに由来するバックグラウンド DNA
DNA サイズおよびシーケンシング後のプロファイルはネイティブな cfDNA を模倣
精度と柔軟性を追求した設計
精度と柔軟性を追求した設計
7種類の VAF パーセンテージから選択可能
VAF パーセンテージの Digital Droplet PCR による検証
すべての VAF パーセンテージを含む便利なセットも利用可能

※ 研究専用です。診断や臨床に使用することはできません。

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データ
Twist のリファレンススタンダードと他社製品との比較

Twist cfDNA Pan-Cancer リファレンススタンダードと他社製品の DNA 解析では、Twist 製品がネイティブなセルフリー DNA をより厳密に模倣し、より忠実な検査結果が得られることが示されています。

蛍光強度
シーケンシング後のプロファイルの比較

シーケンシング後のライブラリサイズ分布を Twist 製と他社製で比較すると、Twist 製品がネイティブ cfDNA サンプルをいかに厳密に模倣しているかが分かります(ピークのギザギザの形状など)。

ライブラリ挿入サイズ
Twist のリファレンススタンダードと他社製品との比較

Twist cfDNA Pan-Cancer リファレンススタンダードと他社製品の DNA 解析では、Twist 製品がネイティブなセルフリー DNA をより厳密に模倣し、より忠実な検査結果が得られることが示されています。

蛍光強度
シーケンシング後のプロファイルの比較

シーケンシング後のライブラリサイズ分布を Twist 製と他社製で比較すると、Twist 製品がネイティブ cfDNA サンプルをいかに厳密に模倣しているかが分かります(ピークのギザギザの形状など)。

ライブラリ挿入サイズ
注文情報
製品 SKU

104549

*Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード セット、300 ng/チューブ 

104542

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0% (WT)、3 μg

104543

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0.1%、3 μg

104544

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0.25%、3 μg

104545

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0.5%、3 μg

104546

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 1%、3 μg

104547

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 2%、3 μg

104548

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 5%、3 μg

104176

Twist Library Preparation Kit with amp mix, Mechanical Fragmentation 16 サンプル

104177

Twist Library Preparation Kit with amp mix, Mechanical Fragmentation 96 サンプル

*キットには以下の 7 種類の VAF がそれぞれ含まれています。0%(WT)、0.1%、0.25%、0.5%、1%、2%、5%(各チューブ 300 ng)

※ 研究専用です。診断や臨床に使用することはできません。

製品 SKU

104549

*Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード セット、300 ng/チューブ 

104542

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0% (WT)、3 μg

104543

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0.1%、3 μg

104544

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0.25%、3 μg

104545

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 0.5%、3 μg

104546

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 1%、3 μg

104547

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 2%、3 μg

104548

Twist cfDNA Pan-cancer リファレンススタンダード VAF 5%、3 μg

104176

Twist Library Preparation Kit with amp mix, Mechanical Fragmentation 16 サンプル

104177

Twist Library Preparation Kit with amp mix, Mechanical Fragmentation 96 サンプル

*キットには以下の 7 種類の VAF がそれぞれ含まれています。0%(WT)、0.1%、0.25%、0.5%、1%、2%、5%(各チューブ 300 ng)

※ 研究専用です。診断や臨床に使用することはできません。

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