様々なアダプターのアプリケーションに対応した単一のブロッキング溶液
様々なアダプターのアプリケーションに対応した単一のブロッキング溶液
様々なアダプターのアプリケーションに対応した単一のブロッキング溶液
概要 データ 注文・仕様 資料
概要

次世代シーケンス(NGS)の効率を高めるためには、シーケンスの前に目的のゲノム領域のターゲットエンリッチメントを行うことが多々あります。Twist Bioscienceのターゲットエンリッチメントワークフローでは、ビオチン化された合成DNAプローブがエクソンやその他のカスタムゲノム領域にハイブリダイズするように設計されています。ゲノムDNAサンプルとハイブリダイゼーションを実施後、プローブを精製して、ターゲット領域が濃縮されたサンプルを作製します。

Twist Universal Blockersは、アダプター配列間の非特異的ハイブリダイゼーションをブロックすることで、ターゲットキャプチャの特異性を高めます。ハイブリダイゼーションの際に非特異的な相互作用をブロックすることで、実験のデザインと実行を簡素化し、シーケンスコストを削減し、ターゲットシーケンス作業の結果を改善することができます。

ブロッカー溶液
オンターゲットキャプチャの改善
TruSeq対応アダプター間のクロスハイブリダイゼーションを抑止
ターゲットエンリッチメントワークフローのパフォーマンスを向上
圧倒的な柔軟性
柔軟性
さまざまなアダプターデザインや多様な長さのバーコードをブロック
シングルプレックスおよびマルチプレックスターゲットエンリッチメントワークフローで有効
パネルサイズに関係なく、オンターゲットキャプチャを改善
最大限の効率化
効率の最大化
そのまま使用できる製剤
サンプルあたりのシーケンスコストを低減
実験デザインと実行の簡略化
ダウンロードする

次世代シーケンス(NGS)の効率を高めるためには、シーケンスの前に目的のゲノム領域のターゲットエンリッチメントを行うことが多々あります。Twist Bioscienceのターゲットエンリッチメントワークフローでは、ビオチン化された合成DNAプローブがエクソンやその他のカスタムゲノム領域にハイブリダイズするように設計されています。ゲノムDNAサンプルとハイブリダイゼーションを実施後、プローブを精製して、ターゲット領域が濃縮されたサンプルを作製します。

Twist Universal Blockersは、アダプター配列間の非特異的ハイブリダイゼーションをブロックすることで、ターゲットキャプチャの特異性を高めます。ハイブリダイゼーションの際に非特異的な相互作用をブロックすることで、実験のデザインと実行を簡素化し、シーケンスコストを削減し、ターゲットシーケンス作業の結果を改善することができます。

ブロッカー溶液
オンターゲットキャプチャの改善
TruSeq対応アダプター間のクロスハイブリダイゼーションを抑止
ターゲットエンリッチメントワークフローのパフォーマンスを向上
圧倒的な柔軟性
柔軟性
さまざまなアダプターデザインや多様な長さのバーコードをブロック
シングルプレックスおよびマルチプレックスターゲットエンリッチメントワークフローで有効
パネルサイズに関係なく、オンターゲットキャプチャを改善
最大限の効率化
効率の最大化
そのまま使用できる製剤
サンプルあたりのシーケンスコストを低減
実験デザインと実行の簡略化
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データ

オフターゲット結合をブロックして、
オンターゲットキャプチャを改善

Twist Universal Blockersは、独自のユニバーサルアダプター配列の混合物を含んでいます。これらの配列は、ゲノムライブラリの断片と結合し、TruSeq対応アダプター間のクロスハイブリダイゼーションをブロックし、オンターゲットキャプチャ率を向上させます。Twist Universal Blockersは、TruSeq対応アダプターを使用するあらゆるターゲットエンリッチメント ワークフローのパフォーマンスを向上させることができます。

デザインの柔軟性を最大化する、
堅牢な設計

Twist Universal Blockersの堅牢なデザインは、柔軟性を最大化し、ターゲットエンリッチメントのワークフローを効率化します。すべてのTwistターゲットエンリッチメント パネルに対応し、インデックス配列の種類、シングルプレックスおよびマルチプレックスのターゲットエンリッチメント ワークフロー全体、パネルサイズに依存せず、オンターゲットキャプチャのリードを改善します。Twist Universal Blockersを使用すると、ターゲットエンリッチメントパフォーマンスを損ねることなく、実験に最適なアダプターインデックスのデザインを選択することができます。

NGS Universal Blockersワークフロー
デザインの柔軟性を最大化する、
堅牢な設計

Twist Universal Blockersの堅牢なデザインは、柔軟性を最大化し、ターゲットエンリッチメントのワークフローを効率化します。すべてのTwistターゲットエンリッチメント パネルに対応し、インデックス配列の種類、シングルプレックスおよびマルチプレックスのターゲットエンリッチメント ワークフロー全体、パネルサイズに依存せず、オンターゲットキャプチャのリードを改善します。Twist Universal Blockersを使用すると、ターゲットエンリッチメントパフォーマンスを損ねることなく、実験に最適なアダプターインデックスのデザインを選択することができます。

NGS Universal Blockers-ターゲット塩基のカバー率グラフ
TruSeqアダプターインデックス設計におけるTwist Universal Blockersのパフォーマンス

パフォーマンスは、インデックスデザインに依存しません。こちらの表では、様々なシングルおよびデュアルインデックスTruSeq互換アダプターにおけるTwistUniversal Blockersのオンターゲットパフォーマンスを示しています。個々のライブラリは、単一ゲノムソース(NA12878;Coriell)と、インデックス長が6~14 bpのTruSeq-compatibleアダプターから作製しました(分子バーコード [Unique Molecular Identifier : UMI] の長さは含まれていません)。エクソーム ターゲットエンリッチメント パネル(33.1Mb;Twist Bioscience)にTwist Universal Blockersを添加/添加なしで、各ライブラリあたり500 ngのゲノムgDNAを、メーカーの推奨する16時間のハイブリダイゼーション反応に従い、ハイブリッドキャプチャを行いました。Cot DNAをすべてのサンプルに含めました。NextSeq 500/550 High Output v2キットを用いて2x76のペアエンドリードでシークエンスしました。データはターゲットサイズの150xにダウンサンプリングし、マッピング品質閾値20の設定でPicard Metricsを使用して解析しました。Bases On-Baitのパーセンテージは、On-BaitとNear-Bait Basesの両方を含み、計算式1 - PCT_OFF_BAIT で定義されます。エラーバーは、標準偏差または観測範囲を示します(N ≥ 2)。

 

NGS 試薬とKits Universal Blockersオンプローブの割合 グラフ1
パネルデザインの柔軟性を最大化する、堅牢なブロッカー設計

パフォーマンスは、パネルサイズに依存しません。こちらの表では、様々なパネルサイズでのTwist Universal Blockersのオンターゲットパフォーマンスを示しています。個々のライブラリは、単一のゲノムソース(NA12878; Coriell)と8 bpのデュアルインデックスTruSeq-compatibleアダプターから作製しました。ハイブリッドキャプチャは、Twist Universal Blockersの非存在下または存在下で、ターゲットエンリッチメント パネル(0.04 Mb~33.1 Mb;Twist Bioscience)を用い、個々のライブラリあたり500 ngのgDNAを使用して、メーカーの推奨する16時間のハイブリダイゼーション反応にしたがって行いました。Cot DNAをすべてのサンプルに含めました。NextSeq 500/550 High Output v2キットを用いて2x76のペアエンドリードでシークエンスしました。データはターゲットサイズの150xにダウンサンプリングし、マッピング品質閾値20の設定でPicard Metricsを使用して解析しました。Bases On-Baitのパーセンテージは、On-BaitとNear-Bait Basesの両方を含み、計算式1 - PCT_OFF_BAIT で定義されます。エラーバーは測定値の範囲を示します;N = 2

NGS 試薬とKits Universal Blockers オンプローブの割合 グラフ2

オフターゲット結合をブロックして、
オンターゲットキャプチャを改善

Twist Universal Blockersは、独自のユニバーサルアダプター配列の混合物を含んでいます。これらの配列は、ゲノムライブラリの断片と結合し、TruSeq対応アダプター間のクロスハイブリダイゼーションをブロックし、オンターゲットキャプチャ率を向上させます。Twist Universal Blockersは、TruSeq対応アダプターを使用するあらゆるターゲットエンリッチメント ワークフローのパフォーマンスを向上させることができます。

デザインの柔軟性を最大化する、
堅牢な設計

Twist Universal Blockersの堅牢なデザインは、柔軟性を最大化し、ターゲットエンリッチメントのワークフローを効率化します。すべてのTwistターゲットエンリッチメント パネルに対応し、インデックス配列の種類、シングルプレックスおよびマルチプレックスのターゲットエンリッチメント ワークフロー全体、パネルサイズに依存せず、オンターゲットキャプチャのリードを改善します。Twist Universal Blockersを使用すると、ターゲットエンリッチメントパフォーマンスを損ねることなく、実験に最適なアダプターインデックスのデザインを選択することができます。

NGS Universal Blockersワークフロー
デザインの柔軟性を最大化する、
堅牢な設計

Twist Universal Blockersの堅牢なデザインは、柔軟性を最大化し、ターゲットエンリッチメントのワークフローを効率化します。すべてのTwistターゲットエンリッチメント パネルに対応し、インデックス配列の種類、シングルプレックスおよびマルチプレックスのターゲットエンリッチメント ワークフロー全体、パネルサイズに依存せず、オンターゲットキャプチャのリードを改善します。Twist Universal Blockersを使用すると、ターゲットエンリッチメントパフォーマンスを損ねることなく、実験に最適なアダプターインデックスのデザインを選択することができます。

NGS Universal Blockers-ターゲット塩基のカバー率グラフ
TruSeqアダプターインデックス設計におけるTwist Universal Blockersのパフォーマンス

パフォーマンスは、インデックスデザインに依存しません。こちらの表では、様々なシングルおよびデュアルインデックスTruSeq互換アダプターにおけるTwistUniversal Blockersのオンターゲットパフォーマンスを示しています。個々のライブラリは、単一ゲノムソース(NA12878;Coriell)と、インデックス長が6~14 bpのTruSeq-compatibleアダプターから作製しました(分子バーコード [Unique Molecular Identifier : UMI] の長さは含まれていません)。エクソーム ターゲットエンリッチメント パネル(33.1Mb;Twist Bioscience)にTwist Universal Blockersを添加/添加なしで、各ライブラリあたり500 ngのゲノムgDNAを、メーカーの推奨する16時間のハイブリダイゼーション反応に従い、ハイブリッドキャプチャを行いました。Cot DNAをすべてのサンプルに含めました。NextSeq 500/550 High Output v2キットを用いて2x76のペアエンドリードでシークエンスしました。データはターゲットサイズの150xにダウンサンプリングし、マッピング品質閾値20の設定でPicard Metricsを使用して解析しました。Bases On-Baitのパーセンテージは、On-BaitとNear-Bait Basesの両方を含み、計算式1 - PCT_OFF_BAIT で定義されます。エラーバーは、標準偏差または観測範囲を示します(N ≥ 2)。

 

NGS 試薬とKits Universal Blockersオンプローブの割合 グラフ1
パネルデザインの柔軟性を最大化する、堅牢なブロッカー設計

パフォーマンスは、パネルサイズに依存しません。こちらの表では、様々なパネルサイズでのTwist Universal Blockersのオンターゲットパフォーマンスを示しています。個々のライブラリは、単一のゲノムソース(NA12878; Coriell)と8 bpのデュアルインデックスTruSeq-compatibleアダプターから作製しました。ハイブリッドキャプチャは、Twist Universal Blockersの非存在下または存在下で、ターゲットエンリッチメント パネル(0.04 Mb~33.1 Mb;Twist Bioscience)を用い、個々のライブラリあたり500 ngのgDNAを使用して、メーカーの推奨する16時間のハイブリダイゼーション反応にしたがって行いました。Cot DNAをすべてのサンプルに含めました。NextSeq 500/550 High Output v2キットを用いて2x76のペアエンドリードでシークエンスしました。データはターゲットサイズの150xにダウンサンプリングし、マッピング品質閾値20の設定でPicard Metricsを使用して解析しました。Bases On-Baitのパーセンテージは、On-BaitとNear-Bait Basesの両方を含み、計算式1 - PCT_OFF_BAIT で定義されます。エラーバーは測定値の範囲を示します;N = 2

NGS 試薬とKits Universal Blockers オンプローブの割合 グラフ2
注文・仕様
仕様

ワークフローステップ

ターゲットエンリッチメント

保管条件

-5 ℃から-30 ℃で保存
製品SKU

100856

Twist Universal Blockers, 2 Reactions 

100578

Twist Universal Blockers, 12 Reactions 

100767

Twist Universal Blockers, 96 Reactions

Twist Universal Blockersは研究専用であり、Twistの供給規約と条件で規定されている追加の使用制限が適用されます。

仕様

ワークフローステップ

ターゲットエンリッチメント

保管条件

-5 ℃から-30 ℃で保存
製品SKU

100856

Twist Universal Blockers, 2 Reactions 

100578

Twist Universal Blockers, 12 Reactions 

100767

Twist Universal Blockers, 96 Reactions

Twist Universal Blockersは研究専用であり、Twistの供給規約と条件で規定されている追加の使用制限が適用されます。

資料