酵素を用いたメチル化シーケンス解析および Twist ターゲットエンリッチメントによる高感度なメチル化検出

酵素を用いたメチル化シーケンスと Twist ターゲットエンリッチメントがどのように融合し、メチル化の検出で優れたパフォーマンスを示すか解説します。

DNAメチル化は、遺伝子発現を調節することにより、細胞増殖において重要な役割を果たしています。場合によっては、異常なシトシンのメチル化による変化が、遺伝子発現によってがんを引き起こす可能性があります。歴史的に見て、これらの修飾を患者のサンプルで同定することは困難でした。バイサルファイト処理を行ったDNAの次世代シーケンス(NGS)が、メチル化シトシン検出の効率的な手段として使われていますが、化学的な変換プロセスがDNAにダメージを与え、GC含量にバイアスのあるカバレッジおよび複雑性の低下につながる可能性があります。したがって、そのようなプロトコルでは検出感度に限界があります。

このテクニカルノートに記載されている事項
バイサルファイトと酵素変換を用いたライブラリ調製法の比較
Twistのターゲットメチル化シーケンスワークフローでのコントロールの使用法
様々なターゲット領域のサイズ、GC含量におけるTwistのターゲットメチル化シーケンスワークフローのパフォーマンス
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