WGS Skim-Seq を用いた植物の形質の遺伝子型と表現型の関連付け

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発表者:
Jason Johns
Jason Johns
カリフォルニア大学サンタバーバラ校博士課程

このウェビナーでわかること
全ゲノムスキムシーケンシングにより、高品質な遺伝子地図を効率的に構築できること
遺伝子地図と QTL 解析を用いて、表現型の原因となるゲノム領域を特定できること
Twist ライブラリ調製によって、多くのサンプルの遺伝子マーカーを効率的かつ費用対効果も高くスクリーニングできること

One of the primary applications of genomics is to connect genotype to phenotype. Linkage mapping utilizes recombination to identify regions of the genome that code for traits of interest. Our lab has used the cost-effective high-throughput Twist 96-Plex Library Prep (Riptide) kit in multiple crosses to perform whole-genome skim sequencing and create high-quality genetic maps. These genetic maps have been used to identify regions of the genome and, using quantitative trait locus (QTL) analysis, specific candidate genes responsible for various plant traits. I will demonstrate our process from raw genomic DNA to a genetic map and QTL. This process can be applied to and adapted for any diploid system.

 

*この結果は、当該研究機関独自で得られたものであり、他の研究機関では必ずしも同じ結果が得られない可能性もあります。

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