部位飽和変異体ライブラリ

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設計通り（99%）の変異を生成

タンパク質工学におけるスクリーニングに、単一部位に関する変異体ライブラリを用いることで、タンパク質の配列空間を探索し、タンパク質の配列と構造・機能との関連性を調べることが可能です。

Twist の Site Saturation Variant Library (部位飽和変異体ライブラリ:SSVL) の構築には、 Twist 独自のシリコンベース DNA合成プラットフォームを用いた超並列オリゴヌクレオチド合成を活用しています。Twist のライブラリは NGS による検証を行うことで、目的の変異がすべて正しい比率で存在していることを確認しています。

正確に作製された変異体ライブラリ

コドン頻度の完全なコントロール（全 64 コドンが利用可能）
各部位における変異導入の高い均一性
不要なコドンや早期終止コドンなし

検証済みの品質

変異導入部位の NGS での検証など厳格な品質管理
配列における変異導入比率を記録
ユーザー定義の変異の均一な分布
早期終止コドンや不要なコドンが入らない

柔軟性

すべての配列、単一または複数の領域、それらの組み合わせ（単一、二重、三重変異）に対応
モジュール式合成系で、繰り返しライブラリ構築可能
TRIM や縮重法よりも高い柔軟性

今すぐライブラリの設計を始めましょう。専門家チームが、お客様のニーズに合わせた完璧なライブラリの設計をお手伝いします。Order and Design here.

大規模な飽和変異スクリーニングによる KRAS

医薬品開発者が KRAS の変異を特徴付けてカタログ化する際に、 Twist の大規模な飽和変異スクリーニングがどのように役立っているのかをご覧ください。

塩基ごとの精度をお確かめください

タンパク質の構造と機能の鍵となる残基を同定するため、 Twist SSVL を用いて配列空間を調べる方法をご紹介します。

医薬品開発者にとって、腫瘍の進展が大きな問題であることをご存じでしたか？

Learn how Twist is helping drug developers characterize and catalog mutations in KRAS through large-scale saturation mutagenesis screens.

配列空間の探索

Site Saturation Libraries は、NNK などの縮重コドンような従来のライブラリ作製法とは異なり、コドンバイアスや不要な置換を避けることができます。

TRIM は反復収量が少なく、典型的なライブラリでは完全長の生成物は 50% 未満しか得られませんが、他方、 Twist ライブラリではより多くの使用可能な変異体が得られ、有効なライブラリサイズが大きくなります。

	ERROR PRONE PCR	縮重コドン（NNK／NNS）	TWIST SITE SATURATION VARIANT LIBRARIES
配列バイアスの除去	いいえ	いいえ	はい
利用可能なコドン数	不明	32	全 64
望ましくないモチーフの回避	いいえ	いいえ	はい
コドン最適化	いいえ	いいえ	はい
終止コドンの回避	いいえ	はい	はい

均一性の高い変異体ライブラリ

Site Saturation Variant Libraries により、スクリーニングアッセイにおいてタンパク質の配列空間を効率的にサンプリングすることができます。

この図は、 Twist SSVL を用いて構築した場合と、error prone PCR を用いて構築した場合に、タンパク質の 65 個の部位（１つの部位につき 19 種類の意図した変異）で観察されたアミノ酸分布を示しています。縦棒は異なるアミノ酸部位を表しており、観測された変異の発現頻度がそれぞれの色で分かります。Twist のライブラリでは、すべての変異は期待通りの比率で存在しています。

新しいライブラリ設計方法

新しいライブラリ設計ツールは、 DNA ライブラリの設計と注文プロセスを合理化し、最適化し、迅速化するためのオールインワン・ソリューションです。

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ライブラリのシーケンスファイルを簡単にアップロードできる直感的でインタラクティブなポータル
潜在的なエラーを瞬時のフィードバックで特定し即座にライブラリの検証が可能
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If you have any questions, please feel free to email us at library@twistbioscience.com

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