クローニング後、正しい配列を持つクローンを見つける確率を高めるために、いくつコロニーのピックアップすべきですか?

標準的な複雑さを持つ配列の場合、エラー率が 7500 分の 1 であることを考慮すると、グラフに示す推奨コロニー数を選択することで、適切な配列を持つコロニーを発見する確率は 95% になります。

この推奨数は、出発点であることにご留意ください。ベクターの種類、配列の複雑さ、配列内容などさまざまな要因が、コロニーの生育に影響を及ぼす可能性があります。場合によっては、推奨コロニー数の 2 ~ 3 倍のコロニーを選択する必要があります。

 

コロニーピッキング


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Gene Fragments の価格を教えてください。

こちらをクリックして、お客様のアカウントにログイン後、Gene Fragments 製品の価格表をご確認ください。

価格に関するお問い合わせは eCommerce 内の、「Account」に記載されている当社担当者までご連絡ください。


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Gene Fragments の分析証明書(COA)はどこで確認できますか?

解析証明書(COA)は出荷後に発行されます。こちらをクリックして、お客様のアカウントにログイン後、Gene Fragments 製品の COA をご確認ください。


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Adapter-On Gene Fragments に使用されているアダプター配列を教えてください。

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。

ご注文につきましてご不明な点がございましたら、カスタマーサポート までお問い合わせください。


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注文した配列の末端にアダプター配列は付加されますか?

Adapter-On Gene Fragments の場合、各断片の末端にユニバーサルアダプターが合成されます。アダプターの長さは 21 ~ 22 ヌクレオチドです。アダプター付き DNA 断片は、制限酵素消化/ライゲーション、Gateway、Golden Gate、TOPO クローニングなど、多くのアセンブリ手法に対応しています。

アダプター内に制限部位を加えることで、アダプターを取り除くことができます。TOPO クローニングにもご利用いただけますが、アダプターは付いたままになります。

 

アダプター配列

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。

ご注文につきましてご不明な点がございましたら、[email protected] までお問い合わせください。 

 


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Adapter-On(アダプター付き) Gene Fragments をクローニングするには、どのような方法がありますか?

以下の方法で、アダプター付き遺伝子フラグメントをクローニングできます。

制限酵素消化/ライゲーション:Twist アダプター内に制限部位を配置してクローニングしやすくします。

IIS 型制限酵素または Golden Gate 法: Twist アダプターの内側に制限部位を配置して、TOPO® クローニング(平滑末端)できるようにする。この方法では、アダプター配列もクローニングされます。

Gateway® クローニング:配列末端に attB 部位を追加します。

詳細はこちらをご覧ください。


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Gene Fragments は精製されていますか?

はい。Gene Fragments については、ビーズを用いて精製を行いますが、短い断片については少量の場合は実施しないこともあります。


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クローニング後、正しい配列を持つクローンを見つける確率を高めるために、いくつコロニーのピックアップすべきですか?

標準的な複雑さを持つ配列の場合、エラー率が 7500 分の 1 であることを考慮すると、グラフに示す推奨コロニー数を選択することで、適切な配列を持つコロニーを発見する確率は 95% になります。

この推奨数は、出発点であることにご留意ください。ベクターの種類、配列の複雑さ、配列内容などさまざまな要因が、コロニーの生育に影響を及ぼす可能性があります。場合によっては、推奨コロニー数の 2 ~ 3 倍のコロニーを選択する必要があります。

 

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Gene Fragments の価格を教えてください。

こちらをクリックして、お客様のアカウントにログイン後、Gene Fragments 製品の価格表をご確認ください。

価格に関するお問い合わせは eCommerce 内の、「Account」に記載されている当社担当者までご連絡ください。


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Gene Fragments の分析証明書(COA)はどこで確認できますか?

解析証明書(COA)は出荷後に発行されます。こちらをクリックして、お客様のアカウントにログイン後、Gene Fragments 製品の COA をご確認ください。


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Adapter-On Gene Fragments に使用されているアダプター配列を教えてください。

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。

ご注文につきましてご不明な点がございましたら、カスタマーサポート までお問い合わせください。


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注文した配列の末端にアダプター配列は付加されますか?

Adapter-On Gene Fragments の場合、各断片の末端にユニバーサルアダプターが合成されます。アダプターの長さは 21 ~ 22 ヌクレオチドです。アダプター付き DNA 断片は、制限酵素消化/ライゲーション、Gateway、Golden Gate、TOPO クローニングなど、多くのアセンブリ手法に対応しています。

アダプター内に制限部位を加えることで、アダプターを取り除くことができます。TOPO クローニングにもご利用いただけますが、アダプターは付いたままになります。

 

アダプター配列

  • 2021 年 8 月 9 日以前のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
    • 3' アダプター:AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
    • 5’ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – insert – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3'

 

  • 2021 年 8 月 9 日~2021 年 11 月 1 日の期間にご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
    • 3' アダプター:AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
    • 5’ - CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – insert – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG - 3'

 

  • 2021 年 11 月 2 日以降のご注文の場合、アダプター配列は以下の通りとなります。
    • 5' アダプター:CAATCCGCCCTCACTACAACCG
    • 3' アダプター:CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
    • 5’ - CAATCCGCCCTCACTACAACCG – insert – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA - 3'

 

※アダプターとは、合成プロセスにおいてインサートの各末端に付加される短い配列のことです。アダプターが付いていない Gene Fragments もご注文頂けます。

ご注文につきましてご不明な点がございましたら、[email protected] までお問い合わせください。 

 


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Adapter-On(アダプター付き) Gene Fragments をクローニングするには、どのような方法がありますか?

以下の方法で、アダプター付き遺伝子フラグメントをクローニングできます。

制限酵素消化/ライゲーション:Twist アダプター内に制限部位を配置してクローニングしやすくします。

IIS 型制限酵素または Golden Gate 法: Twist アダプターの内側に制限部位を配置して、TOPO® クローニング(平滑末端)できるようにする。この方法では、アダプター配列もクローニングされます。

Gateway® クローニング:配列末端に attB 部位を追加します。

詳細はこちらをご覧ください。


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Gene Fragments は精製されていますか?

はい。Gene Fragments については、ビーズを用いて精製を行いますが、短い断片については少量の場合は実施しないこともあります。


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