メチル化

ハイブリッドキャプチャを最適化するために、以下の条件を変更可能です。

• ハイブリダイゼーション時間：推奨通り２時間から始めて、30 分～４時間の間で変更します。
• 迅速洗浄バッファー 1 の温度：65 ℃で始めて、63 ～ 66 ℃の間で調整します。

最終的なライブラリ収量は 50～75 ng/μl と予測されます。収量は、スタート時のインプットの質に左右されます。

はい。本キットには、 CpG メチル化 pUC19 DNA および非メチル化ラムダ DNA が含まれています。これらのコントロールは、ライブラリ調製時の酵素変換効率を決定するために使用することができます。

注：内部コントロールは、エンリッチメントパネルにコントロール特異的プローブを追加しない限り、キャプチャワークフローに含めるべきではありません。

以下の表をご覧ください。

最低で 10～20 ng、最高で 200 ng の高品質な DNA をお使いいただくことを推奨します。

はい、最大８プレックスまでのマルチプレックス化に対応しています。シングルプレックスでは 200 ng のライブラリ、８プレックスのキャプチャでは 1500 ng（または 187.5 ng ずつ）のライブラリを使用することを推奨します。

メチル化エンハンサーを使用しても、ハイブリッドセレクションの指標が損なわれることはありません。メチル化エンハンサーは、カスタムメチル化パネルのターゲット領域やゲノム DNA インプットのメチル化レベルに応じてオフターゲットを低減します。一部のカスタムパネルでは、オフターゲットを 50% 低減できる可能性があります。

Twist は、メチル化変換を行ってライブラリを構築するアプリケーションでは物理的断片化のみを利用しています。

200 ～ 300 bp です。

いいえ。ハイブリッドキャプチャは、 Twist 迅速ハイブリダイゼーション (Twist Fast Hyb) システムで行う必要があります。

350 ～ 450 bp です。

ハイブリッドキャプチャを最適化するために、以下の条件を変更可能です。

• ハイブリダイゼーション時間：推奨通り２時間から始めて、30 分～４時間の間で変更します。
• 迅速洗浄バッファー 1 の温度：65 ℃で始めて、63 ～ 66 ℃の間で調整します。

最終的なライブラリ収量は 50～75 ng/μl と予測されます。収量は、スタート時のインプットの質に左右されます。

はい。本キットには、 CpG メチル化 pUC19 DNA および非メチル化ラムダ DNA が含まれています。これらのコントロールは、ライブラリ調製時の酵素変換効率を決定するために使用することができます。

注：内部コントロールは、エンリッチメントパネルにコントロール特異的プローブを追加しない限り、キャプチャワークフローに含めるべきではありません。

以下の表をご覧ください。

最低で 10～20 ng、最高で 200 ng の高品質な DNA をお使いいただくことを推奨します。

はい、最大８プレックスまでのマルチプレックス化に対応しています。シングルプレックスでは 200 ng のライブラリ、８プレックスのキャプチャでは 1500 ng（または 187.5 ng ずつ）のライブラリを使用することを推奨します。

メチル化エンハンサーを使用しても、ハイブリッドセレクションの指標が損なわれることはありません。メチル化エンハンサーは、カスタムメチル化パネルのターゲット領域やゲノム DNA インプットのメチル化レベルに応じてオフターゲットを低減します。一部のカスタムパネルでは、オフターゲットを 50% 低減できる可能性があります。

Twist は、メチル化変換を行ってライブラリを構築するアプリケーションでは物理的断片化のみを利用しています。

200 ～ 300 bp です。

いいえ。ハイブリッドキャプチャは、 Twist 迅速ハイブリダイゼーション (Twist Fast Hyb) システムで行う必要があります。

350 ～ 450 bp です。