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概要

精密な変異体遺伝子ライブラリ技術で、目的のスクリーニングを実現

Twist のシリコンベース超並列 DNA合成プラットフォームは、非常に均一かつ正確なオリゴの製造を可能にします。90% のオリゴが平均値の 2.5 倍未満で存在すると共に、業界トップクラスの低エラー率 1 : 2,000 nt を実現しました。

Twist が持つ分子生物学の専門的基盤を活用したオリゴ合成プラットフォームにより、優れたバリアント表現と、不要なバイアスやモチーフのないユーザーが希望する通りの組成を有する、高多様性の遺伝子変異体ライブラリの作製が可能です。Twist のライブラリテクノロジーは、変異体遺伝子の配列空間の網羅的な探索を可能にします。

高多様性・高精度
高多様性・高精度
単一または複数の領域へ複数の変異を容易に導入
コドン頻度(全 64 コドン)、アミノ酸分布、長さのばらつきを精密に制御
検証済みの品質
検証済みの品質
変異導入部位の NGS での検証など厳格な品質管理
配列における変異率を記録
ユーザー定義の変異の均一な分布
未成熟終止コドンや不要なコドンなし
柔軟性
柔軟性
すべての配列、単一または複数の領域、それらの組み合わせ(単一、二重、三重変異)に対応
モジュール式合成系で、ライブラリ構築を繰り返し可能
TRIM や縮重法よりも高い柔軟性
精密な変異体遺伝子ライブラリ技術で、目的のスクリーニングを実現

限られた領域(例えば CDR)で複雑かつ高多様性を持つライブラリを構築する Twist Bioscience の能力について、そして構築物の長さに多様性を持つ人工 DNA ライブラリの構築を可能にする技術の進歩について、詳しくご紹介します。

ウェビナーを視聴する

精密な変異体遺伝子ライブラリ技術で、目的のスクリーニングを実現

Twist のシリコンベース超並列 DNA合成プラットフォームは、非常に均一かつ正確なオリゴの製造を可能にします。90% のオリゴが平均値の 2.5 倍未満で存在すると共に、業界トップクラスの低エラー率 1 : 2,000 nt を実現しました。

Twist が持つ分子生物学の専門的基盤を活用したオリゴ合成プラットフォームにより、優れたバリアント表現と、不要なバイアスやモチーフのないユーザーが希望する通りの組成を有する、高多様性の遺伝子変異体ライブラリの作製が可能です。Twist のライブラリテクノロジーは、変異体遺伝子の配列空間の網羅的な探索を可能にします。

高多様性・高精度
高多様性・高精度
単一または複数の領域へ複数の変異を容易に導入
コドン頻度(全 64 コドン)、アミノ酸分布、長さのばらつきを精密に制御
検証済みの品質
検証済みの品質
変異導入部位の NGS での検証など厳格な品質管理
配列における変異率を記録
ユーザー定義の変異の均一な分布
未成熟終止コドンや不要なコドンなし
柔軟性
柔軟性
すべての配列、単一または複数の領域、それらの組み合わせ(単一、二重、三重変異)に対応
モジュール式合成系で、ライブラリ構築を繰り返し可能
TRIM や縮重法よりも高い柔軟性
精密な変異体遺伝子ライブラリ技術で、目的のスクリーニングを実現

限られた領域(例えば CDR)で複雑かつ高多様性を持つライブラリを構築する Twist Bioscience の能力について、そして構築物の長さに多様性を持つ人工 DNA ライブラリの構築を可能にする技術の進歩について、詳しくご紹介します。

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データ
高品質なデータ

Twist Bioscience のシリコンベース DNA合成プラットフォームおよびライブラリテクノロジーにより、信頼性の高いデータがより短期間で得られる高品質のライブラリをご利用いただけます。他の2つの競合技術と比較すると(図を参照)、 Twist のライブラリは設計したアミノ酸頻度からのずれが 1% 未満でした。Twist の in silico DNA合成プラットフォームによって、設計されたアミノ酸比率との正確な一致に加えて、望ましい結合モチーフや鎖長のバリエーションをマルチドメインライブラリにシームレスに組み込むことができるので、変異空間の網羅的解析を可能にする変異体遺伝子ライブラリを正確に設計し、カスタマイズすることができます。

また、 Twist ライブラリでは、NNK ライブラリや TRIM ライブラリにありがちな問題や課題を回避することができます。各変異体は塩基単位でプリントされ、合成前にスクリーニングされるため、終止コドン、悪影響を与えるモチーフ、不要な変異、望ましくないバイアスなどがすべてプロセスの最初に排除されます。その結果、機能面で要求通りの変異体がライブラリに濃縮され、スクリーニングにおける負荷が軽減されます。

業界をリードする当社のライブラリはすぐに使えて、高度な多様性を有し、かつ精密に設計されており、研究目標を達成する、より多くのチャンスを手にすることができます。

Twistテクノロジー比較 NNK vs Trimer vs Twist
優れたライブラリ

Twist には分子生物学の高度な専門的基盤があり、変異体遺伝子ライブラリを精密に構築することが可能です。当社の一塩基制御アプローチにより、スクリーニングプロセスに悪影響を与えるモチーフを排除した高多様性ライブラリをご提供可能です。当社は、目的とする変異をお客様自身が決めた比率で備えた、比類のない品質かつ完全カスタマイズのライブラリをご用意します。ここではその品質を表すコンビナトリアル変異ライブラリ (CVL) の例を示しています。7つの連続したアミノ酸についての変異体が作製され、それぞれの位置で予想通りの変異が見られ、ほぼすべてが目的とする比率になっています。

Position 1 と Position 6 では、野生型アミノ酸がそれぞれ 40%(Position 1)と 30%(Position 6)の比率になるよう設計されました。残りの 18 種のアミノ酸は、いずれも 3.3% 程度の低い割合となるよう設計されました。

Position 3 から Position 5 では、アミノ酸残基すべてが設計値、実測値とも 5.3%でした。

変異体遺伝子ライブラリCVL分布
ユーザー定義 CDR ライブラリ

Twist Bioscience の精密な変異体遺伝子ライブラリでは、どのような CDR(相補性決定領域)配列をフレームワークに組み込むかを選択することができます。

各 CDR はコドン最適化が可能で、不要な制限部位が含まれないようにすることができます。機械学習はすでに、抗体ライブラリの解析や、例えばより高い親和性や特異性をもたらすような特定の CDR の組み合わせを同定するためのツールとして用いられており、科学研究に不可欠な要素となっています。

Twist のシリコンベース合成プラットフォームと一緒に用いて、解析の結果得られた明確なライブラリの組み合わせを完全人工合成ライブラリにシームレスに組み込むことで、変異空間の探索を洗練させることができます。

ユーザー定義 CDR ライブラリ

 

ライブラリのクローニングオプション

 

当社のプラットフォームでは、高度に複雑なオリゴヌクレオチドを均一に合成することができ、下流のワークフローにおいて潜在的なバイアスを最小限に抑えることができます。当社の科学者チームは、ライブラリの作製とクローニングにおいて均一性を維持する方法を開発しました。それらは、バイアスを導入してしまうことが知られているステップについてです。そうしたバイアスは、ワークフロー中における、スクリーニングやアッセイで一部の変異が不均衡に現れることにつながります。クローニングされたライブラリは、出発点の均一性を維持し、ドロップアウトや予定よりも変異導入が下回ってしまうことを最小限に抑えることで、高いレベルの多様性を維持することができ、スクリーニングの時間と労力の削減に貢献します。

 

アミノ酸の測定

この図は、作製後(Linear)とクローニング後(Cloned)の各変異位置で観察されたアミノ酸分布を、設計時の頻度分布(Expected)と比較したものです。

 

NGS で品質管理されたライブラリ

NGS を用いてすべてのライブラリが検証されているため、機能向上が見込めない変異をネガティブデータから特定し、次のライブラリ設計の際に削除することができます。

この表は、ライブラリリニアアセンブリ後およびクローニング後の変異ドメインの4つの部位におけるアミノ酸頻度(%)です。各部位の想定(Expected)側の列には、設計時に規定されたアミノ酸置換頻度が示されています。このデータは、予想されるすべての変異がそれぞれの部位で存在し、アセンブリとクローニングを通して均一性が維持されたことを示しています。

 

ORF
高品質なデータ

Twist Bioscience のシリコンベース DNA合成プラットフォームおよびライブラリテクノロジーにより、信頼性の高いデータがより短期間で得られる高品質のライブラリをご利用いただけます。他の2つの競合技術と比較すると(図を参照)、 Twist のライブラリは設計したアミノ酸頻度からのずれが 1% 未満でした。Twist の in silico DNA合成プラットフォームによって、設計されたアミノ酸比率との正確な一致に加えて、望ましい結合モチーフや鎖長のバリエーションをマルチドメインライブラリにシームレスに組み込むことができるので、変異空間の網羅的解析を可能にする変異体遺伝子ライブラリを正確に設計し、カスタマイズすることができます。

また、 Twist ライブラリでは、NNK ライブラリや TRIM ライブラリにありがちな問題や課題を回避することができます。各変異体は塩基単位でプリントされ、合成前にスクリーニングされるため、終止コドン、悪影響を与えるモチーフ、不要な変異、望ましくないバイアスなどがすべてプロセスの最初に排除されます。その結果、機能面で要求通りの変異体がライブラリに濃縮され、スクリーニングにおける負荷が軽減されます。

業界をリードする当社のライブラリはすぐに使えて、高度な多様性を有し、かつ精密に設計されており、研究目標を達成する、より多くのチャンスを手にすることができます。

Twistテクノロジー比較 NNK vs Trimer vs Twist
優れたライブラリ

Twist には分子生物学の高度な専門的基盤があり、変異体遺伝子ライブラリを精密に構築することが可能です。当社の一塩基制御アプローチにより、スクリーニングプロセスに悪影響を与えるモチーフを排除した高多様性ライブラリをご提供可能です。当社は、目的とする変異をお客様自身が決めた比率で備えた、比類のない品質かつ完全カスタマイズのライブラリをご用意します。ここではその品質を表すコンビナトリアル変異ライブラリ (CVL) の例を示しています。7つの連続したアミノ酸についての変異体が作製され、それぞれの位置で予想通りの変異が見られ、ほぼすべてが目的とする比率になっています。

Position 1 と Position 6 では、野生型アミノ酸がそれぞれ 40%(Position 1)と 30%(Position 6)の比率になるよう設計されました。残りの 18 種のアミノ酸は、いずれも 3.3% 程度の低い割合となるよう設計されました。

Position 3 から Position 5 では、アミノ酸残基すべてが設計値、実測値とも 5.3%でした。

変異体遺伝子ライブラリCVL分布
ユーザー定義 CDR ライブラリ

Twist Bioscience の精密な変異体遺伝子ライブラリでは、どのような CDR(相補性決定領域)配列をフレームワークに組み込むかを選択することができます。

各 CDR はコドン最適化が可能で、不要な制限部位が含まれないようにすることができます。機械学習はすでに、抗体ライブラリの解析や、例えばより高い親和性や特異性をもたらすような特定の CDR の組み合わせを同定するためのツールとして用いられており、科学研究に不可欠な要素となっています。

Twist のシリコンベース合成プラットフォームと一緒に用いて、解析の結果得られた明確なライブラリの組み合わせを完全人工合成ライブラリにシームレスに組み込むことで、変異空間の探索を洗練させることができます。

ユーザー定義 CDR ライブラリ

 

ライブラリのクローニングオプション

 

当社のプラットフォームでは、高度に複雑なオリゴヌクレオチドを均一に合成することができ、下流のワークフローにおいて潜在的なバイアスを最小限に抑えることができます。当社の科学者チームは、ライブラリの作製とクローニングにおいて均一性を維持する方法を開発しました。それらは、バイアスを導入してしまうことが知られているステップについてです。そうしたバイアスは、ワークフロー中における、スクリーニングやアッセイで一部の変異が不均衡に現れることにつながります。クローニングされたライブラリは、出発点の均一性を維持し、ドロップアウトや予定よりも変異導入が下回ってしまうことを最小限に抑えることで、高いレベルの多様性を維持することができ、スクリーニングの時間と労力の削減に貢献します。

 

アミノ酸の測定

この図は、作製後(Linear)とクローニング後(Cloned)の各変異位置で観察されたアミノ酸分布を、設計時の頻度分布(Expected)と比較したものです。

 

NGS で品質管理されたライブラリ

NGS を用いてすべてのライブラリが検証されているため、機能向上が見込めない変異をネガティブデータから特定し、次のライブラリ設計の際に削除することができます。

この表は、ライブラリリニアアセンブリ後およびクローニング後の変異ドメインの4つの部位におけるアミノ酸頻度(%)です。各部位の想定(Expected)側の列には、設計時に規定されたアミノ酸置換頻度が示されています。このデータは、予想されるすべての変異がそれぞれの部位で存在し、アセンブリとクローニングを通して均一性が維持されたことを示しています。

 

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ご注文
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はじめに

  • ステップ 1:本ページの連絡先フォームにご記入いただき、SUBMIT をクリックします
  • ステップ 2:Download the CVL Submission Form and fill out all fields in the form for your library design
  • ステップ 3:本ページの「ファイル送信」タブをクリックして、記入した提出フォームをアップロードしてください
Tabコンポーネント右
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提出の準備はよろしいですか?

  • ステップ 1:記入済みの提出フォームをアップロードします
  • ステップ 2:当社ライブラリ担当の専門家がお客様のプロジェクトを確認します
  • ステップ 3:ライブラリ担当がプロジェクトを確認後、お見積もりのご連絡をします
  • ステップ 4:お客様がお見積もりをご承諾後、ライブラリ担当はプロジェクトを製造担当に送ります

ご不明な点がございましたら、お気軽に {{[email protected]}} までメールでお問い合わせください

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